氨基酸和蛋白质的一级结构基本内容.PDF

免费考研网 制作pdf 版本 武汉大学生科院张楚富教授等原作！非常感谢！ 第二章 氨基酸和蛋白质的一级结构 基本内容 蛋白质含有20 种标准氨基酸，这些氨基酸在它们的·碳原子上分别含有一个氨基、一个羧基和一个侧链基团 （或称R 基 团）。除甘氨酸外，所有其它氨基酸的·碳原子都是一个不对称的碳原子，即手性碳原子。蛋白质中的所有氨基酸都是 L-型的。 20 种标准氨基酸可以根据它们侧链的结构分为含脂肪烃基的氨基酸、含芳香基的氨基酸、含硫的 （或含羟基的、或含酰 胺基的）氨基酸。如果根据它们的侧链极性 （或在生理pH 下的解离），可分为侧链非极性氨基酸、侧链不带电荷的极性 氨基酸和侧链解离带正电荷或负电荷的氨基酸。氨基酸侧链的性质对于决定蛋白质的性质、结构和功能来说是很重要的。 氨基酸的·-氨基和·-羧基都是可解离的基团，它们的解离取决于介质的pH。在生理pH 下，·-氨基解离带正电荷 （ñ NH3+），·-羧基解离带负电荷 （ñCOO ñ）；侧链可解离基团的解离取决于它们的pK 值和介质的pH。氨基酸的解离性质 是建立分离和分析氨基酸的方法的基础，它们的解离也影响蛋白质的性质、结构和功能。分离分析氨基酸的主要方法是 离子交换法以及电泳法。 蛋白质是由氨基酸借肽键连接而成多聚物。在蛋白质多肽链中，肽键是唯一的共价键，由一个氨基酸的·-羧基和相邻氨 基酸的·-氨基脱水缩合而成。在多肽链中，氨基酸残基的顺序称为蛋白质的一级结构。 蛋白质是生物大分子，虽然它们具有与氨基酸相似的解离性质，但这一性质却比氨基酸复杂。蛋白质的许多重要的性质， 例如，溶解性、极性、带电性质、分子大小以及配体亲和性等，是构成分离分析它们的方法的基础。离子交换法、凝胶 过滤法、亲和层析法、超速离心法以及各种电泳法是常用的方法。 蛋白质一级结构的测定通常采用这样的程序，即纯净样品的末端分析、氨基酸组成分析、专一性酶或化学试剂进行部分 水解、Edman 降解法测定肽碎片的氨基酸残基的顺序以及片段重叠。末端分析常有丹磺酰氯法和二硝基氟苯法；肽链的部 分水解一般是有胰蛋白酶法、胰凝乳蛋白酶法以及溴化氰法。 氨基酸顺序的分析能揭示不同来源的蛋白质彼 此之间的进化关系，亦为分子病的诊断提供可靠的依据。 第二章 氨基酸和蛋白质的一级结构 习题 2 ñ1．图2ó1 的滴定曲线描述了谷氨酸的电离。请回答下列问题：①指出三个pKía 的位置；②指出Glu－和Giu＝各 一半时的pH；③指出谷氨酸总是带净正电荷的pH 范围；④指出Glu±和Glu－能作为一种缓冲液的共轭酸碱对的pH 范围. 图2-1 谷氨酸的酸-碱滴定曲线 2 ñ2．为什么甘氨酸处在等电点时是以偶极离子的形式存在，而不是以完全不带电荷的形式存在？处在等电点时，其完 全不带电荷的形式是多少? 2 ñ3．甘氨酸是乙酸甲基上的氢被氨基取代生成的，但是，甘氨酸羧基的pKía 值比乙酸羧基 pKía 低。为什么? 2 ñ4．在pH9.0 时，计算赖氨酸的两性离子、阳离子以及阴离子所占的比例。已知赖氨酸三个可电离基团·-COOH，·ñ NH3+和Â- NH3+的pKía 值分别为2.18、8.95 和10.53。 2 ñ5．用强酸型阳离子交换树脂分离下述每对氨基酸，当用 pH7.0 的缓冲液洗脱时，下述每对中先从柱上洗脱下来的是 哪种氨基酸? ①天冬氨酸和赖氨酸；②精氨酸和甲硫氨酸；⑧谷氨酸和缬氨酸;④甘氨酸和亮氨酸；⑤丝氨酸和丙氨酸。 2 ñ6．计算出由Ala、Gly、His、Lys 和Val 所构成的可能的五肽数目。 2 ñ7．在大多数氨基酸中，·ñCOOH 的pKía 值都接近2.0，·ñNH3＋的pKía 值都接近9.0。但是，在肽中，·ñCOOH 的pKía 值为3.8，而·ñNH3＋的pKía 比值为7.8。你能解释这种差别吗? 2 ñ8．某蛋白质用凝胶过滤法测定的表观分子量是90kD；用SDS测定时，它的表观分子量是60kD，无论2-巯基乙 醇是否存在。哪种测定方法更准确？为什么？ 2 ñ9．一种分子量为24,000、pI 为5.5 的酶被一种分子量类似、但pI 为7.0 的蛋白质和另外一种分子量为100,000、pI 免费考研网 制作pdf 版本 免费考研网 制作pdf 版本 为5.4 的蛋白质污染。提出一种纯化该酶的方案。 2 ñ10．下面的数据是从一个八肽降解和分析得到的，其组成是：Ala、Gly2、Lys、Met、Ser，Thr、Tyr。该八肽 用CNBr 处理，得到：①Ala、Gly、Lys、Thr； ②Gly、Met、Ser、