[生物学]第3章 基因与基因组.pptVIP

本课程的任务是介绍生物大分子的结构与功能；复制、转录、翻译的过程和基因表达调控的方式以及分子生物学的常用技术与应用。使学生了解有关分子生物学的基本理论知识和研究方法，为今后的学习、科研打下良好的分子生物学基础。 教材及主要参考书 教材：赵亚华 《基础分子生物学教程》，科学出版社 P.C. Turner et al. 2009. Instant Notes in Molecular Biology(分子生物学精要速览)，3rd edition，Bios Scientific Publishers Limited. 朱玉贤 《现代分子生物学》，高等教育出版社 孙乃恩 《分子遗传学》，南京大学出版社。 阎隆飞 《分子生物学》，中国农业大学出版社， 李振刚 《分子遗传学》，科学出版社 Jame Watson等著. Molecular Biology of the Gene (第五版), Cold Spring Harbor Press出版，2004. Weaver R. Molecular Biology. 科学出版社 学习方法 1. 注重理解，融会贯通 重点强调知识体系的建立，掌握脉络、主干和重点。 2.勤学多问，孜孜不倦 善于勤学多问，与老师、同学多交流探讨。 3.跟踪前沿，引深思维 经常查阅相关文献 4.举一反三，温故知新 做好预习、经常复习 5. 勤做笔记 第三章 原核与真核生物的基因组 教学目的和要求 1. 掌握基因、基因组、断裂基因、基因家族、内含子、外显子等基本概念。 2. 掌握原核生物与真核生物基因组的结构特点。 3. 理解基因组复杂度。 第1节 基因与基因组 一、 基因的概念 二、基因的命名 三、基因组 基因（gene）：原核生物、真核生物以及病毒的DNA和RNA分子中具有遗传效应的核苷酸序列，是遗传的基本单位。 三、基因组 1. 基因组的概念 是指一种生物体中的整套遗传信息，一般为一个受精卵或一个体细胞的细胞核中所有DNA分子的总和。 一特定生物体的整套(单倍体)遗传物质的总和。 基因组的大小用全部DNA的碱基对总数表示。 每种真核生物的单倍体基因组中的全部DNA量称为C值 (C-Value)。 一、原核生物基因组的特点 拟核（类核）结构；基因组相对较小，由DNA组成，包括染色体DNA和质粒DNA两种DNA分子，均为共价闭环双链。染色体DNA为单拷贝 存在多顺反子结构；功能相关的基因常常组织形成操纵子结构，操纵子结构是原核基因组的一个突出的结构特点。 除RNA基因外，基本是单拷贝的； 利于核糖体的快速组装，短时间内合成 大量核糖体。 结构基因通常为连续基因，非编码区和重复序列少； 存在不同的功能识别区，每个DNA分子（染色体DNA和质粒DNA）只有一个复制起始点。 复制起始区、复制终止区等 含可转移的序列，如插入序列、转座子等。 Negatively supercoiled (负超螺旋) as a whole 一、真核生物基因组特点： 真核生物基因组DNA与蛋白质结合形成染色体，储存于细胞核内，体细胞是双倍体（diploid），即有两份同源的基因组。 真核细胞基因转录产物为单顺反子。　　 存在重复序列，重复次数可达百万次以上。 基因组中不编码的区域多于编码区域。 大部分基因含有内含子，因此，基因是不连续的。 基因组远远大于原核生物的基因组，具有许多复制起点，而每个复制子的长度较小。 二、 基因组的复杂度 Genomic DNA extraction ? Sonication or shearing to a uniform size (x 100-1000 bp) ? Thermal Denaturation ? Re-annealing Measure plotting the re-annealing process will yield kinetics 二、 基因组的复杂度 1) 据基因组重复次数高低： 重复序列 Unique sequence DNA单一序列DNA 复性最慢 在基因组中有一个或几个拷贝。真核生物的大多数基因在单倍体中都是单拷贝的。如：蛋清蛋白、血红蛋白等) 单一序列中储存了巨大的遗传信息，编码各种不同功能的蛋白质。 moderately repetitive DNA中度重复序列 中度重复序列是指在基因组中重复十几次至几十万次的部分，其复性速度快于单拷贝序列，但慢于高度重复序列。 中度重复序列在基因组中所占比例在不同种属之间差异很大，一般为12～35%，人类基因组中约占12%。 moderately repetitive DNA中度重复序列