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[研究生入学考试]核酸的结构与功能

类别 名称 作用方式 底物 产物 RNA酶 DNA酶 核酸酶 R N A RNase T1 内切 -GpN- Gp,-Gp RNase A 内切 -PypN- Pyp,-Pup RNase U2 内切 -PupN- Pup,-Pup RNase T2 内切 -NpN- Np RNase H 内切 与DNA杂交的RNA pN D N A DNase I 内切 DNA pN,pN- DNase II 内切 DNA Np,-Np 链球菌DNase 内切 DNA pN,pN- 限制性内切酶 (RE) 内切,切点位于特殊的碱基序列 双链DNA 粘端DNA,平端DNA R N A, D N A 核酸酶P1 内切、外切 DNA、RNA pN 核酸酶M 内切 DNA、RNA Np 核酸酶S1 内切 单链DNA或RNA pN 牛脾磷酸二酯酶 外切 DNA、RNA Np 蛇毒磷酸二酯酶 外切 DNA、RNA pN 不同性质的核酸酶 1 11 18 19 15 17 19 14 20 DNA的非标准二级结构 细胞内的DNA在特殊的条件下还可能形成其它几种非标准的二级结构。这些特殊的条件包括:DNA受到某些蛋白质的作用(如组蛋白);DNA本身所具有的特殊基序,例如反向重复序列,回文结构,镜像重复,直接重复,高嘌呤序列,高嘧啶序列,富含A序列和富含G序列。 (1)弯曲 (2)十字形 (3)P-DNA (4)三链螺旋与H-DNA (5)四链螺旋与G-四联体 (5)滑动错配DNA(SMP-DNA) 十字形DNA的形成 P-DNA与B-DNA的比较 滑动错配DNA DNA的三级结构——超螺旋 如果通过某种手段使得DNA双螺旋每一圈的碱基对数目多于或少于10对,将导致DNA双螺旋缠绕过多或缠绕不足;如果这时的DNA两端被固定或者DNA本来是共价闭环的,的张力无法释放而自发地形成超螺旋结构。 DNA超螺旋分为正超螺旋和负超螺旋,其中正超螺旋为左手超螺旋,由DNA双螺旋过度缠绕引起,负超螺旋为右手超螺旋,由DNA双螺旋缠绕不足引起。 DNA复制过程中正超螺旋DNA的形成 从DNA双螺旋到染色体 电镜下的核小体结构 核小体结构模型 RNA的二级结构 RNA的二级结构主要取决于它的碱基组成,其二级结构的多样性可以和蛋白质相媲美。少数病毒RNA由两条互补的多聚核糖核苷酸链组成,它的二级结构为A型双螺旋。多数RNA仅由一条链组成,它们的二级结构主要是由链内碱基的互补性决定的:链内互补的碱基可以相互作用形成链内A型双螺旋,非互补的碱基则游离在双螺旋之外,形成各种二级结构。在RNA双螺旋内常常可以发现GU碱基对。 RNA分子中的GU碱基对 RNA的三级结构 构成RNA的三级结构的主要元件有假节结构、“吻式”发夹结构和发夹环突触结构(等三种形式。tRNA则可形成倒L型三级结构 tRNA tRNA分子只由一条链组成,含有73~94个核苷酸,其中有不少是修饰的核苷酸或修饰的碱基,3′-端的最后三个核苷酸总是CCA,链内的大多数碱基通过氢键相连,但几乎所有的tRNA分子上不变的核苷酸都在三叶草结构上非氢键区域。构成tRNA二级结构的要素有:环、茎和臂。一个典型tRNA的二级结构像三叶草,含有四个环和四个茎。环由链内没有配对的碱基突出而成,茎则是链内互补的碱基之间配对形成的局部A-型双螺旋,臂则是紧靠着茎又不属于环的非配对核苷酸。 tRNA三级结构形成的原因是D环上的碱基与不变碱基以及TψC环上的碱基之间的发生的氢键作用。这些氢键将D臂和TψC臂折叠到一起,并将三叶草二级结构弯曲成稳定的倒L型三级结构。参与三级结构形成的许多氢键并不是通常的AU和GC碱基对。 RNA的倒L形三级结构 图12-31 tRNA三级结构之中的氢键配对 tRNA三级结构之中的氢键配对 tRNA三级结构之中的氢键配对 rRNA 核糖体合成蛋白质 所有的核糖体都含有大小两个亚基 rRNA约占据核糖体的2/3 高度的链内互补序列导致大量的碱基配对 rRNA 充当核糖体蛋白的支架 大肠杆菌的23S rRNA是转肽酶! 一级结构上相似性并不高,但它们的二级结构却惊人地相似。 核糖体的整体构象由rRNA决定,核糖体蛋白质一般正好位于RNA螺旋之间 16S rRNA的二级结构 原核生物核糖体小亚基rRNA的三维结构 原核生物核糖体大亚基rRNA的三维结构 mRNA DNA的转录产物,蛋白质的翻译模板 原核生物多为多顺反子 真核生物多为单顺反子,5′-端具有帽子,3′-端具有多聚腺苷酸尾巴。 出现在mRNA分子上最多的二级结构部件也是茎环结构。mRNA分子的二级结构,特别是两端的二级结构对于翻译有影响,而某些mRNA借助于末端特殊的二级结构对基因的表达进行调控。 核酸的理化性质 紫外

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