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fsq酶切步骤
2. DNA酶切反应
载体和PCR产物分别用以下条件进行双酶切(反应体系均为50ul,37℃,酶切3小时):
pBlue/Pyes2 50ul 插入片段 50ul 10x buffer2 5ul 10x buffer2 5ul DNA ≤2ug(20ul) DNA(A,B,C,D) ≤2ug(20ul) 100xBSA 0.5ul 100xBSA 0.5ul HindⅢ 1ul HindⅢ 1ul XbaⅠ 1ul XbaⅠ 1ul ddH2O 32.5 ddH2O ---
1) 将清洁干燥并经灭菌的ep管(最好0.5ml)编号,分别标记:A;B;C;D;pY;pB, 然后安装上表添加各剂量。
2) 添加好个试剂后,用手指轻弹管壁使溶液混匀,也可用微量离心机甩一下,使溶液集中在管底。此步操作是整个实验成败的关键,要防止错加,漏加。使用限制性内切酶时应尽量减少其离开冰箱的时间,以免活性降低。
3) 混匀反应体系后,将ep管置于适当的支持物上(如插在泡沫塑料板上),37℃水浴保温2-3小时,使酶切反应完全。
4) 每管加入2μl 0.1mol/L EDTA(pH8.0),混匀,以停止反应,置于冰箱中保存备用。
5)电泳:
点样6组:
Marker;③酶切后的载体pYESⅡ;④酶切前的载体pBlue;⑤酶切后的pBlue。
6)进行切胶回收。
7)采用Sanpre柱式PCR产物回收试剂盒回收双酶切后的目的DNA。
3. 连接
上述双酶切产物经过纯化(其中载体酶切产物割胶回收,PCR片段酶切后纯化步骤与上述PCR产物纯化步骤相同),在T4 DNA连接酶作用下16℃连接过夜(5h)。连接体系如下:
试剂 剂量/ul(10ul) 试剂 剂量/ul(10ul) 载体pBlue 2 载体pYES2 2 pBX 3.5 pBX 3.5 10xT4 buffer 1 10xT4 buffer 1 T4 DNA ligase 1 T4 DNA ligase 1 ddH2O 至10uL ddH2O 至20uL
1 X ?T4 ?DNA? 连接酶缓冲液 [ 50 mM Tris-HCl(pH 7.5 @ 25 ),10 mM MgCl2,10 mM DTT,1 mM ATP]。推荐 DNA 5 末端浓度为 0.1-1.0 μM。16 温育。
DNAX pmoles×长度bp×650)/ 1,000,000 (注:长度bp×650 是该双链DNA 的分子量)所得数值即为μg,也可以直接用这个公式套.1pmol 1000bpDNA=0.66μg,载体pYES2是5.8kb,则0.03pmol 为 0.03×5.857×0.66=0.116μg;载体pBlue是3kb,0.03pmol为0.0594ug。
目的DNA是1.3kb,0.3pmol是0.257ug. 如果是1:5,则加128ng。
4. 转化:a、全量(10 μl)加入至100 μl JM109感受态细胞中,冰中放置30分钟。 b、42℃加热45秒钟后,再在冰中放置1分钟。 c、加入400μl AMP阴性培养基,37℃振荡培养60分钟。 取100μl铺板。也可离心后余100μl
5. 扩培和检验
平板在37℃恒温箱中培养12-16小时,发现生长有清晰的菌落时,进行挑单菌落扩培。每样挑5个菌落,分别培养在装有1mL LB+1ul Amp培养基的1.5mLEP管中,37℃,200转/分钟。
6. 杆菌DH5α制备
1) 取保存的大肠杆菌DH5α接种于LB固体培养基,37℃培养过夜不超过16。
从大肠杆菌的培养平板上挑取单菌落接于含2mL LB液体培养基的试管中。37℃200rpm振荡培养过夜。
以1%的接种量将过夜培养的菌液接种于LB液体培养基中,37℃ 200
rpm振荡培养3h左右OD600=0.3)。
4) 将菌液转移到1.5mL离心管中,冰上放置10min4000rpm, 离心10min
回收细胞。
5) 彻底去上清后,加入1mL冰冷的0.1mol/L CaCl2,悬浮沉淀,冰浴30min。6) 4℃, 4000rpm, 离心10min彻底去掉上清冰上加入0.1mL 0.1mol/L CaCl2悬浮细胞7) 加入15甘油,混匀,置于-80℃保存。
8) 以标准质粒确定感受态细胞的转化率。
转化感受态大肠杆菌
1) 取出-80℃保存的大肠杆菌感受态细胞,待感受态细胞刚解冻时,将连接产物加入其中,充分混匀,冰浴30min。
2) 42℃休克90s (注意不要摇动离心管),冰浴5min。
3) 加入400μl不含Amp的LB培养基,轻轻混匀4) 37℃, 小于100 rpm振荡培养45min?1h。
5) 4000rpm离心10min, 吸掉部分上清剩余约1
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