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云大生化7.蛋白质III
第三章
蛋白质的三维结构
蛋白质的一级结构不具有
功能,只有形成正确的结构才
具有功能。二级结构以上的结
构叫高级结构,由于高级结构
是指各原子或基团在空间上的
分布,所以又叫空间结构,或
三维结构。
一、蛋白质的二级结构
维持空间构象的作用力
(一)维持蛋白质空间构象的作用力
作用力 破坏因子
氢键: α-螺旋,β-折叠 尿素,盐酸胍
H2NC(:NH)NH2 HCl
疏水作用: 形成球蛋白的核心 去垢剂,有机溶剂
Van der Waals力:稳定紧密堆积的集团和原子
离子键:稳定α-螺旋,三、四级结构 酸、碱
二硫键:稳定三、四级结构 还原剂
配位键:与金属离子的结合 螯合剂 EDTA
Pauling 的生涯
LinusCarl Pauling1901-1994
1926年,留学Sommerfeld实验室(1年7个月)
1928年,发明杂化轨道,创立量子化学
1930年,去Laurence Bragg实验室学X-ray衍射
1936年,与Mirsky一起发表蛋白质变性的理论氢键
1937年,开始搭α-helix的模型,发现5.4A的周期,与
Astbury的Keratin蛋白测定得到的5.1A不符。此后化了
约10年的时间测定各种含肽键的小分子的结构,得出肽
键的6个原子在同一平面上的结论
1949年,人造丝X-ray数据发表,他看到了5.4A的周期
1950年,α-helix模型发表,次年发表β-sheet模型
1954年,Nobel化学奖
1963年,Nobel和平奖
70年代,提倡Vitamin C治百病
(二)影响蛋白折叠的因素
1.二面角的转动
2.非键合原子之间的最小接触距离
两面角
两个肽平面以一个Cα为中心发生旋转
肽链中的肽平面
非键合原子最小接触距离
C N O H
0.320 0.290 0.280 0.240
C (0.300) (0.280) (0.270) (0.220)
0.270 0.270 0.240
N (0.260) (0.260) (0.220)
0.270 0.240
O (0.260) (0.220)
0.200
H (0.190)
Ramachandran Plot
Ramachandran Plot
二、典型的二级结构
肽平面的相叠形成α螺旋
1.
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