云大生化7.蛋白质III.pdfVIP

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云大生化7.蛋白质III

第三章 蛋白质的三维结构 蛋白质的一级结构不具有 功能,只有形成正确的结构才 具有功能。二级结构以上的结 构叫高级结构,由于高级结构 是指各原子或基团在空间上的 分布,所以又叫空间结构,或 三维结构。 一、蛋白质的二级结构 维持空间构象的作用力 (一)维持蛋白质空间构象的作用力 作用力 破坏因子 氢键: α-螺旋,β-折叠 尿素,盐酸胍 H2NC(:NH)NH2 HCl 疏水作用: 形成球蛋白的核心 去垢剂,有机溶剂 Van der Waals力:稳定紧密堆积的集团和原子 离子键:稳定α-螺旋,三、四级结构 酸、碱 二硫键:稳定三、四级结构 还原剂 配位键:与金属离子的结合 螯合剂 EDTA Pauling 的生涯 LinusCarl Pauling1901-1994 1926年,留学Sommerfeld实验室(1年7个月) 1928年,发明杂化轨道,创立量子化学 1930年,去Laurence Bragg实验室学X-ray衍射 1936年,与Mirsky一起发表蛋白质变性的理论氢键 1937年,开始搭α-helix的模型,发现5.4A的周期,与 Astbury的Keratin蛋白测定得到的5.1A不符。此后化了 约10年的时间测定各种含肽键的小分子的结构,得出肽 键的6个原子在同一平面上的结论 1949年,人造丝X-ray数据发表,他看到了5.4A的周期 1950年,α-helix模型发表,次年发表β-sheet模型 1954年,Nobel化学奖 1963年,Nobel和平奖 70年代,提倡Vitamin C治百病 (二)影响蛋白折叠的因素 1.二面角的转动 2.非键合原子之间的最小接触距离 两面角 两个肽平面以一个Cα为中心发生旋转 肽链中的肽平面 非键合原子最小接触距离 C N O H 0.320 0.290 0.280 0.240 C (0.300) (0.280) (0.270) (0.220) 0.270 0.270 0.240 N (0.260) (0.260) (0.220) 0.270 0.240 O (0.260) (0.220) 0.200 H (0.190) Ramachandran Plot Ramachandran Plot 二、典型的二级结构 肽平面的相叠形成α螺旋 1.

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