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资料奉献给我的同学以及学弟学妹或者刚使用到 软件的朋友们 2008-1-29 Mapmaker3.0 winQTLCart2.0 简单中文教程 和举例 胡磊 （新疆农业大学农学院棉花遗传育种2006 级研究生） 本文是笔者自己的试验方法记录里得来的，尽量使用通俗易懂的语言，配合截图，基本 上看过的人都可以学会使用。但是由于时间紧促，难免存在疏漏和错误的地方，欢迎指正！ 此资料仅供参考，因此引 的后果概不负责，特 声明。 一、前期数据准备 1 数据调查和采样 数据调查：我们把群体中的每个材料种成行，比如3m 一行，在这一行里选取 10 株做 调查，已果枝始节为例，调查10 株，并记录在记录本或者电脑里备用。 采 样：在上面说的3m 一行的里取指甲盖大小的叶片，回实验室提NDA ，跑电泳， 和读带。 用 2 数据输入 2.1 大田数据 先把你的田间调查数据输入excel，以f2 代果枝始节调查数据为例。在最后一列算出平 使 均数。注意！我们需要用的就是这个平均数！数据输入的时候，材料编号那里不能出错。 部 内 2.2 实验室数据 然后就是我们采回来的叶片跑的电泳记录，这里的叶片都是大田里取来的，全部需要提 取DNA 和跑电泳。最后在所跑出来的电泳条带上读取数据，读取数据的方法如下： 如图所示，此图显示的是凝胶上的带型。 联系方式：qq 邮箱：ownnumber@163.com 1 资料奉献给我的同学以及学弟学妹或者刚使用到 软件的朋友们 2008-1-29 共显性标记： 本带型记为 “B ”，父本带型记为 “A ”，杂合带型记为 “H ”。显性标记 记载有两种情况：若 本等位基因为显性，则父本带型记为 “A ”，杂种带型记为 “D ”；若 父本等位基因为显性，则 本带型记为 “B ”，杂种带型记为 “C ”。无论在显性标记还是共 显性标记中，由于某些原因造成的带型不清或数据缺失均用 “–”表示。 而我们在读取的时候一般用数字表示，即：1=A 2=B 3=H 4=C 5=D 。在读带后的数据输 入也要注意编号，编号一定不能出错。 用 3 数据处理 3.1 数据核对 将DNA 的编号和大田数据进行对比，如果DNA 里有的编号，在材料编号里没有，就 把那一行数据用 “- ”表示，单元格下移。如果材料编号里有的数据，而DNA 里没有。那就 把材料编号和平均数数据一 删除，原则是以DNA 数据为主，同时和大田调查的农艺性状 数据一一对应。如图： 使 部 内 3.2 检验数据 调查的数据如果不符合正态分布是不能引用的，数据是否符合正态分布可以用EXCEL 联系方式：qq 邮箱：ownnumber@163.com 2 资料奉献给我的同学以及学弟学妹或者刚使用到 软件的朋友们 2008-1-29 来检验，操作步骤为：选中你要带入处理的数据，例如平均结铃数。注意，因为这里面还有 前面处理时加入的 “- ”，要将“-”去除，用 将其排序，选中数字而不选 “- ”。 然后依次 工具 数据分析 描述统计，注意，描述统计的时候不要忘了再次选中你要 分析的数据。 用 使 部 内 从结果里看，峰度和偏度两个值的大小，这两个值大小必须小于 1.0，而我们的数据不 符合，这就需要再次处理数据，将数据标准化。 联