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实验2 ERIC-PCR指纹图谱技术
实验二
ERIC-PCR指纹图谱技术 在分子
生态学中的应用
实 验 目 的
• 明确ERIC-PCR技术用于分析微生物群
落结构的原理。
• 掌握ERIC-PCR的操作方法。
ERIC (Enterobacterial Repetitive Intergenic
Consensus)-PCR
Hulton,1991 Versalovic, Gillings,1997b
1991 ERIC-PCR可以从
首次在肠道细
植物、动物、真
菌基因组中发 发明ERIC- 菌等的基因组
现ERIC序列 PCR，对细菌 DNA中扩增出稳
的基因组DNA进 定的、多态性丰
行指纹图分析 富的图谱。
高平平,2003 Di Giovanni, Gillings,1997a
1999
Wei,2004 ERIC-PCR不只
用ERIC-PCR分 针对ERIC序列，
将ERIC-PCR
析混合菌群的组 实际上是一种“长
方法引入复杂
成 引物随机PCR
环境微生物群
(LP-RAPD)”
落的研究
ERIC-PCR是一种长引物随机PCR技术
普通RAPD LP-RAPD
引物常为8-10bp的单 单个或一对长度大
个引物 于16bp的引物
退火温度低于40℃ 退火温度高于52℃
图谱稳定、重复性高，对底物
图谱稳定、重复性高，对底物
的序列差异敏感性高，产生的
的序列差异敏感性高，产生的
图谱多态性丰富
图谱多态性丰富
PCR反应的一般原理
PCR: 聚合酶链式反应，即通过引物延伸核酸
的某个区域而进行的重复双向DNA合成。
PCR原理
ERIC-PCR程序
• 95℃, 7min
• 94℃, 1min (变性)
52℃, 1min (退火)
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