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培养基筛选的利器设计designofexperimentdoe-sartorius
DOE - 培养基筛选的利器
实验设计(Design of Experiment, DOE) 自20 世纪初创以来,在产品设计、生产过程控制、质量
优化工程等方面得到了普遍的推广和应用。随着2005 年,FDA 对质量源于设计(Quality by
Design,QbD )概念的提出,越来越多的制药过程不仅采用DOE 提高实验效率,也通过其进
行质量和风险控制。
本文中主要介绍了DOE 中的混料设计(Mixture Design)在培养基混合筛选中的应用。
在传统的培养基筛选中,往往是将细胞株分别培养于3~10 种培养基,而后对目标产物的产
率,以及质量进行检测,从而来筛选适合的培养基。这种方法至今为止也是广泛使用的,然
而在某些情况下未必能够满足生产要求。在培养基筛选过程中,往往会发现细胞在某种培养
基中能够达到很高的细胞密度,然而 PCD 不高,而另外一种培养基,PCD 较高,细胞密度
较低。或者,一种培养基得到高产率,而另外一种得到高质量。在这样的状况下,培养基混
合很可能会是一个简单快捷的解决方案。
从工艺放大的角度,我们建议尽量不要将大于 3 种培养基,且选择同一品牌的培养基进行
混合。原因是在工艺放大后,培养基混合会使得操作复杂化,而如果混合的培养基为同一
品牌,在大规模生产中,可以采用培养基定制来解决这一问题。
基本概念
DOE 是用于帮助更有效地研究X 和Y 之间的关系,也即Y=f (x),其中y 为是响应值,也即实验
中的输出值,在细胞培养中可以是单细胞产率Pcd,也可以是质量,或者是活细胞密度VCD 。
x 也就是因子,即可能会对结果产生影响的因素。f (x),模型,即是符合Y 和x 关系的方程式。
混料设计
试验者要通过试验得出各种成分比例与指标的关系。例如,某种不锈钢由铁、镍、铜、铬4
种元素组成,我们想知道每种元素所占比例与抗拉强度的数量关系。对于该类问题,研究的
是在整个产品中各个成分所占的比率问题,显然,这些比率的总和应该为 100%。研究这类
问题的实验设计称为混料设计。
案例研究
背景介绍
TM TM TM
在传统的培养基筛选中,发现Sartorius/Lonza 提供的PowerCHO 1,PowerCHO 2,ProCHO 4
三种培养基能得到较高产率的抗体,现采用混料设计来研究是否可以通过优化三种培养基的
混合比率,来进一步提高产率。
实验设计
本文中采用的DOE 软件为Umetrics 的MODDE (vesion 10) 。
第1 步
TM TM TM
输入x ,分别为x = ProCHO 4 ,x = PowerCHO 1,x =PowerCHO 2,取值范围均为0%-100%。
1 2 3
第2 步
输入y ,产率mg/ml
第3 步
选择MODDE 自动推荐的Modified Simplex cCentroid 模型,点击home 中的design wizard 按
钮产生工作表。在工作表中,第1 列Exp No 为默认的实验编号;第2 列Exp Name 为实验名
称,可以默认也可以自行命名;第3 列Run Order 为随机化的实验顺序;第4 列Incl/excl 可
以人为选着是否需要这一组实验,推荐默认,即全部为 Incl;第5-7 列为 Modified Simplex
Centroid 模型的实验组合,在本案例中也就是不同的培养基比率的组合。其中,11-13 行为
中心点的3 个重复,以评估整个实验的可重复性。第8 列为实验输出,也即y 。
第4 步
根据以上工作表的组合以及顺序(Run Order)行实验,得出的Y 值填入工作表的第8 列。
第5 步
点击Home 中的Analysis Wizard 按钮,进行模型评估。在DOE 软件中,有大量的参数可以用
来评估或辅助评估模型,主要有Results Variation ,Response Distribution ,Significance of
Terms,Residuals Normal Probability Plot,Obs
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