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CN106991296-CN201710209168-基于随机化贪心特征选择的集成分类方法

(19)中华人民共和国国家知识产权局 (12)发明专利申请 (10)申请公布号 CN 106991296 A (43)申请公布日 2017.07.28 (21)申请号 201710209168.7 (22)申请日 2017.04.01 (71)申请人 大连理工大学 地址 116024 辽宁省大连市甘井子区凌工 路2号 (72)发明人 孟军 张晶  (74)专利代理机构 大连理工大学专利中心 21200 代理人 温福雪 侯明远 (51)Int.Cl. G06F 19/24(2011.01) 权利要求书3页 说明书8页 附图2页 (54)发明名称 基于随机化贪心特征选择的集成分类方法 (57)摘要 一种基于随机化贪心特征选择的集成分类 方法,属于生物信息学和数据挖掘领域,对植物 胁迫响应相关的基因表达数据进行分类。包括如 下步骤:(1)在传统的贪心算法中引入随机性进 行特征选择;(2)使用在复杂网络中作为社区发 现评价指标的加权本地模块化函数作为随机化 贪心算法的启发信息;(3)在每个特征子集上使 用支持向量机算法训练基分类器;(4)对基分类 器采用近邻传播聚类算法进行聚簇划分;(5)使 用聚簇中作为类代表点的基分类器进行集成,采 用简单多数投票法形成集成分类模型。本发明能 够根据基因表达数据识别植物样本是否受到胁 A 迫,极大的提高了对微阵列数据的分类精确度, 6 而且算法的泛化能力强,具有非常好的稳定性。 9 2 1 9 9 6 0 1 N C CN 106991296 A 权 利 要 求 书 1/3页 1.一种基于随机化贪心特征选择的集成分类方法,其特征在于,步骤如下: (1)在传统的贪心算法中引入随机性进行特征选择 随机选取第一个特征,来扩大对特征的搜索空间; (2)将在复杂网络中作为社区发现评价指标的加权本地模块化函数,作为随机化贪心 算法的启发信息 复杂网络的特性有小世界、无标度和社区结构,本集成分类方法将数据挖掘技术与复 杂网络相结合,使用复杂网络中社区发现的评价指标作为启发信息进行特征选择; 加权本地模块化函数计算过程如下: 1)构建加权无向图G(V,A),其中,基因微阵列数据集中的样本作为图中的顶点,对于任 意两个顶点v 和v ,如果v ∈k-NN(v)或v ∈k-NN(v),则两个顶点之间存在权重为WE=exp 1 2 1 2 2 1 (-d(v,v))的边;k-NN(v)包含顶点v 的k近邻,d(v ,v)为两个顶点之间的距离; 1 2 1 1 1 2 2)依据样本的类别自然地对样本进行社区的划分 3)对于每个特征子集,计算其基于加权本地模块化函数的重要度,表达式如下: 其中:c为待分类基因微阵列数据集的类别数量;w 是在第i个社区中内部边权重的总 i 和;W 是社区i中内部边加上邻接边权重的总和;v 是社区i中所有顶点的度的总和,顶点的 i i 度代表与其邻接的边的权重总和; 引入随机性的基于加权本地模块化函数的特征选择过程如下: 1)设置当前的特征子集F={}; 2)随机选取一个特征加入到F中; 3)对于每个不包含在F中的特征g,依据属性集合F+{g

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