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“合成生物学”与“国际遗传机器大赛( international Genetically Engineered Machine Competition, iGEM)”;合成生物学;何时出现合成生物学这一名字?;Nature Biotechnology, 27(12),2009-12-7Focus on Synthetic Biology;; ● 维基百科全书:合成生物学旨在设计和构建工程化的生物系统,使其能够处理信息、操作化合物、制造材料、生产能源、提供食物、保持和增强人类的健康和改善我们的环境。/Synthetic_biology
● 简单地说,合成生物学是通过设计和构建自然界中不存在的人工生物系统来解决能源、材料、健康和环保等问题。
;合成生物学的定义;How is this different from genetic engineering?合成生物学与基因工程有何不同?;1998; 2004年被美国MIT出版的《Technology Review》评为将改变世界的10大新出现的技术之一(10 Emerging Technologies That Will Change Your World)。;合成生物学发生与发展的学科基础; 1953年,Watson和Crick阐明了DNA的双螺旋结构。;DNA是生物的遗传物质; 人类的DNA序列是人类的真谛,这个世界上发生的一切事情,都与这一序列息息相关。
—— R. Dulbecco, 1986 ;基因、基因组和基因组学:;于1990年正式启动,于2003年4月14日完成了人类基因组全部序列测定;模式生物基因组计划;A C G T;为了整理和分析这些序列信息,诞生了一门新兴的交叉学科---生物信息学——是合成生物学的学科基础之一。;细胞: 奇异绝妙的小工厂;系统生物学研究细胞对外界环境变化或刺激在各个层次上如何做相应的变更, 并建立数学模型对总体应答作出预测.;Systems biology as a foundation for genome-scale synthetic biology;基因组超大量的序列和结构数据 ? 重大的生物技术;合成生物学发生与发展的学科基础;合成生物学的研究内容;生物大分子的合成与模块化;核酸分子的人工合成
允许高效构建相关的在特殊区域有所改变的基因簇;
允许目标基因的柔性设计而不需常规基因重组或克隆所需的中间步骤;
允许用户选择只包括期望功能和途径的人工合成基因,简化或切断生物进化作用所带来的影响;
允许用户插入任意期望的模块,具有可扩展性;
如设计成只有在实验室特殊条件中才能存活的形式,则更具有安全性。;核酸分子的人工合成
DNA从??合成(de novo DNA synthesis)技术
S. A. Benner等人人工制造了两种核苷:K和X,组成了被其称之为AEGIS (An Expanded Genetic Information System)的系统,而且证明了核苷酸的种类可以多达12种之多。
斯坦福大学的化学家E. T. Kool在原有的四种碱基上增加苯环,形成新的四种碱基,并制造了加长的双螺旋新分子“xDNA”,增加了DNA双链的间距,使DNA分子双链的氢键断裂温度提高。这段双螺旋能在黑暗的环境中发光并且能在较高的温度下仍然保持稳定。;1979年H. G. Khorana合成了酪氨酸阻遏tRNA基因(207bp);
2002年纽约州立大学石溪分校魏玛(E.Wimmer)小组用了3年的时间合成出了脊髓灰质炎病毒(Poliovirus)的全基因组,7500bp。
2003年,J. C. Venter 研究小组用了14天时间从头合成了噬菌体Phi X174(5386 bp)基因组。
2004年,人工合成了1918年造成全世界上千万人死亡的“西班牙流感病毒”。
2008年J. C. Venter小组又合成了Mycoplasma genitalium生殖道支原体基因组(582790kb),这是迄今为止人类在合成生物过程中走得最远的一步。
J. C. Venter小组?的另外一项工作却获得了成功:不久前将关系较近的两株支原体中一株的基因组用另外一株的基因组替换,结果仍能正常“工作”。;基因组简化(Genome reduction);;最小细菌基因组的必要条件;/deg/;Database of Essential Genes 5210 (DEG 4.0);枯草杆菌(Bacillus subtilis);生殖道支原体(Mycoplasma genitalium);流感嗜血杆菌(Haemophilus influenzae) ;第一步是重新注释野生型噬菌体T7基因组。
第二步是将含有39977个碱基对的T7噬菌体
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