〖医学〗剥脱性青光眼基因定位的研究现状及方法进展讲义幻灯.pptVIP

剥脱性青光眼基因定位的研究现状及方法进展 汕头大学·香港中文大学联合汕头国际眼科中心 剥脱性青光眼(Exfoliation glaucoma , XFG) 年龄相关的系统性疾病,是世界上继发性开角型青光眼的最常见病因 累及部位 眼前节组织:晶状体囊、瞳孔缘 、角膜后、小梁网、虹膜后、睫状体、晶状体悬韧带、玻璃体前表面 眼外组织 :结膜、眼睑、眼外肌 等 剥脱性青光眼(Exfoliation glaucoma , XFG) 分布具地域性,多见于白人,患病率0-38﹪ 中国人群中的患病率非常低 北京80岁以上:1.17﹪ 香港60岁以上:0.4﹪ 新加坡华人40岁以上:0.2﹪,60岁以上:0.7﹪ XFG分子生物学研究 发病确切的分子生物学机制未明 家族聚集现象在XFG中较常见,且XFG患者亲属的患病率显著高于正常人 遗传方式多样,主要为常染色体不完全显性遗传,少数为常染色体隐性遗传 结果 XFG相关的染色体位点 18q12.1-21.33、2q32.3、 5q33.3、17p13.3、 19q12、Xp22.2 XFG相关的基因 LOXL1,微纤维蛋白-1(fibrillin-1)、间质金属蛋白酶-2组织抑制因子(tissue inhibitor of MMP 2,TIMP-2) XFG主要致病相关基因:LOXL1 候选基因研究 已知的XFG发病相关的候选基因或染色体位点 关联或重新测序的方法 常染色体基因变异位点的关联研究要比重新测序简单经济,已经成为鉴别多基因遗传性疾病常基因变异位点的最强有力手段 缺点:基本病理生理基础未知 时,候选基因研究就不足以研究该病发生的基因学基础,这时就要用全基因组筛查来寻找致病基因 全基因组研究 连锁分析 遗传位点标记定位致病基因,该类标记位点在病人亲属与疾病或疾病性状共分离,因此该方法在家系的致病基因筛选中有其独特的优势 优点是为易感基因提供一种无偏倚的全基因组的筛查方法,已成功应用于孟德尔单基因遗传病致病基因的筛查 缺点为对于多基因遗传病和数量性状的筛查效果不理想。 全基因组研究 关联研究 测定目标是数以万计的连锁不平衡片断,因此它检测常基因变异位点的能力更强 应用病例-对照研究,测定某单核苷酸酸多态性的基因型在病例及对照中是否存在显著性差异 缺点价格昂贵 微点阵基因表达研究 DNA微点阵序列是由数千个显微镜下可见的DNA寡核苷酸小点组成的微阵列构成。每一个DNA寡核苷酸小点均含有若干皮摩尔的特异性DNA序列。这些作为探针的特异性DNA序列可以同时识别一个或几个基因,在条件控制严格的情况下,它们可与目的cDNA或是cRNA片段特异性识别杂交。探针与目的片段杂交的检测定量可通过荧光基团、银或化学发光标记的靶点,从而检测目的片段中核苷酸序列量的多少。 Affymetrix芯片 通过共价键黏附于化学基质(该过程通过环氧甲硅烷、氨基甲硅烷、赖氨酸、聚丙烯酰胺等来实现)的方法,探针黏附于固体表面。该类固体是玻璃或硅片,即通常所说的基因芯片,或Affymetrix芯片。除用固体实现黏附过程外, 微显微串珠(microscopic beads) 微点阵基因表达研究 微显微串珠(microscopic beads) 新的DNA及RNA检测技术,由Illumina公司研发 原理:微显微串珠(microscopic beads)是一种利用3微米硅石串珠在光导纤维束或平面硅石片附着物的微孔内自动汇聚的原理发展起来的新微点阵技术。当串珠在上述两种附着物内自由聚集的时候,串珠间的距离一致,大约5.7微米。在Illumina’s测定中,每一个串珠表面附以成千上万的可捕获序列的特异性寡核苷酸序列,从而对目的片段进行识别。 用于大量DNA或RNA分析