43_细胞周期.pptVIP

大多数细胞进行时断时续分裂周期，在“检查站暂停”以确保为细胞周期的下一阶段做好准备。在G1，G2和M期的结束点处有很多检查点，虽然并非所有的细胞都使用这些检查点。 在早期胚胎发生中，这些检查点处于瘫痪状态，细胞尽可能快得分裂，分裂由周期振荡驱动的。G1期检查点通常被称为开始，因为G1期检查点决定了所有的细胞系统是否为S期和DNA复制作好了准备。开始之前，新生细胞能够离开有丝分裂周期进行分化（有特化功能的不分裂的细胞）。然而，在开始以后，新生细胞已通过检查点并致力于另一轮的DNA合成和分裂。 数学模型的一部分 在实验中，设计方法来控制正反馈的强度，然后测量相空间中的曲线。 强正反馈情况。 弱正反馈情况。 双稳态对周期的调控： 数学模型揭示，低的蛋白合成率导致分裂比较慢，而高的的蛋白合成率导致分裂比较快。 低的蛋白合成率导致分裂比较慢，而高的的蛋白合成率导致分裂比较快 上述论点是有生物学证据支持的。 例如，爪蟾受精卵分裂速度差异巨大，大的细胞只有30分钟即可分裂一次，但小的细胞需要500分钟才分裂一次。而生物学上认为大的细胞有高的蛋白合成率。 大的细胞 高的蛋白合成率 分裂比较快 3. 2 裂殖酵母 在前面的通用模型中我们已经看到了细胞周期是如何运转的，现在我们转向更真实的裂殖酵母的细胞周期（Novak 2001年;Tyson 2002年）。由于细胞周期的不同突变体可以用相应的分岔图来解释，因此这个模型很有吸引力。芽殖酵母细胞周期的复杂模型由 Chen （2000年，2004年），Ciliberto（2003年）和 Allen 等人 （2006年）建立，而诺瓦克和泰森（2004年）对哺乳动物细胞周期的模型进行了讨论。不过，我们现在需要对在细胞周期的主要参与者引进新名称。下表列出了类似物种的不同名称。 有丝分裂促进因子：MPF 在通用模型中，细胞周期的核心成员是CDK-cyclinB 复合体。在裂殖酵母中，细胞周期蛋白依赖性激酶被称为Cdc2，而B型细胞周期蛋白被称为Cdc13（见表）。细胞周期核心的Cdc2：Cdc13复合体被称为有丝分裂促进因子，或MPF。只有当Cdc2与细胞周期蛋白，Cdc13结合，Cdc2才有活性，因此MPF的活性驱动细胞周期。 为理解MPF的作用机制，我们需要了解MPF是的形成，降解和失活。 当Cdc2与Cdc13结合时，MPF形成; 因为Cdc2的量是过剩的，MPF形成率只取决于有Cdc13的量。形成率假定依赖于细胞的物质量，因为Cdc13可以在细胞核内部生成，如前面所讨论的CycB。 由于Rum1，Cdc25 和Slp1的活性是由MPF控制，因此MPF引发一系列非常复杂的相互作用的反馈。 MPF 主要降解途径是活性APC，在裂殖酵母中其辅助部件被称为Ste9和Slp1 MPF可通过两个主要途径失活：- 它可以由Wee1激酶磷酸化转变成一种叫做preMPF的蛋白。反过来，PreMPF可以去磷酸化转变成MPF此过程是磷酸化形式Cdc25，1酪氨酸磷酸酶起作用。- 它可以结合Rum1被抑制，形成一个非活跃的三聚体 由于Rum1，Cdc25 和Slp1的活性是由MPF控制，因此MPF引发一系列非常复杂的相互作用的反馈。下面我们重温这些内容。现在，我们只集中对MPF三聚体，Cdc13和Rum1方程建模。我们遵循诺瓦克等人的模型 （2001年），他构建了模型时，把Cdc13的总量，Rum1的总量和preMPF作为3个独立的变量。 首先，我们确定Cdc13的总量， 其中 X1, X2, 和 X3 标在上图中。类似地我们有 对于Rum我们假定守恒 我们进一步假定，cdc13 （不管什么状态）都有统一的降解率，并被APC (这里是Slp1 and Ste9)控制： 其中，kwee and k25 表示 Wee1 及 cdc25 对 此的影响，这参数本身受MPF影响。 注意，d [preMPF] 中， [Cdc13T] - [preMPF] 即 MPF+ X2 因此，我们进一步推导MPF的公式。 这里是 [Cdc13T] 推导MPF的公式先从 Trimer 开始。我们假定 x1 和 x3 平衡，即两个红箭头平衡 这样 同样，假定 x2 和 MPF 平衡，即两个蓝箭头 平衡，这样 其中 Kd 是 Rum1 的平衡的常数。 进一步，有 解出 Trimer 二次方程的根 其中， 注意，我们取了那个小的根，因为要保证 [Cdc13T] ? 0 时，有 [Trimer] ? 0。 接着，由 preMPF 的式子 以及 [Cdc13T] 的式子 最后可得 三套主要的反馈 至此，我们已有关于[Cdc13T]和[preMPF] 微分方程，这些方程与 [T