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中山大学linux及并行调试培训

Intel编译器 Intel编译器是由intel公司发布的一款编译器,主要包括C语言编译器和Fortan语言编译器两部分,对C++支持。intel编译器一般搭配采用intel处理器的计算机使用,这样的搭配通常比其它编译器结合intel处理器的使用效果要好。 intel的C编译器叫icc,C++编译器叫icpc,Fortran编译器叫ifort * Intel编译器 安装过程 准备好安装包和license文件 设定环境变量,指定license文件位置 export INTEL_LICENSE_FILE=/public/sourcecode/intel-compiler 解压缩(C/C++编译器) tar zxvf l_cproc_p_11.1.059_intel64.tgz cd l_cproc_p_11.1.059_intel64/ * Intel编译器 安装过程 ./install 输入2回车 输入accept回车 前几步一路回车 * Intel编译器 安装过程 输入2回车 输入/public/software/intel/Compiler/11.1/059回车 * Intel编译器 安装过程 同样的方法安装Fotran编译器l_cprof_p_11.1.059_intel64.tgz 配置环境变量 把license文件复制到 /public/software/intel/Compiler/11.1/059/licenses 拷贝环境变量配置文件 cp /public/software/intel/Compiler/11.1/059/bin/intel64/if*sh /etc/profile.d/ cp /public/software/intel/Compiler/11.1/059/bin/intel64/ic*sh /etc/profile.d/ cp /public/software/intel/mkl/tools/environment/mklvarsem64t.*sh /etc/profile.d/ 激活环境 source /etc/profile.d/iccvars_intel64.sh source /etc/profile.d/ifortvars_intel64.sh source /etc/profile.d/mklvarsem64t*.sh * Intel编译器 测试 编写简单的C或Fortran源文件,如hello.f,内容如下: program hello print *,”hello!” end 编译 ifort -o hello hello.f 运行 ./hello * 目 录 第一章 Linux操作介绍 安装准备 系统安装 基本配置及命令 第二章 集群并行调试 集群基础环境调试 常用编译器的安装与配置 MPI并行库的安装与调试 常用数学库的安装与调试 * OpenMPI OpenMPI是Open Source High Performance Computing推出的一个高性能消息传递库,其接口标准与MPI-2一致,并且有一些非常实用的特征,如对千兆网和infiniband网络同时兼容,支持异构网络,并且其性能表现佳,在高性能计算中应用十分广泛。 本例中OpenMPI安装包是OpenMPI-1.4版。为满足各类用户需求,将OpenMPI编译成不同版本,与GNU、PGI、Intel等编译器相关联。 * OpenMPI 安装过程 准备好安装包openmpi-1.4.tar.gz GNU版OpenMPI的编译安装 tar -zxvf openmpi-1.4.tar.gz cd openmpi-1.4/ ./configure --prefix=/public/software/mpi/openmpi1.4-gnu --enable-mpirun-prefix-by-default make -j 8 make install * OpenMPI 安装过程 PGI版OpenMPI的编译安装 tar -zxvf openmpi-1.4.tar.gz cd openmpi-1.4/ ./configure --prefix=/public/software/mpi/openmpi1.4-pgi --enable-mpirun-prefix-by-de

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