育种规划最优化法总结概括.ppt

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育种规划最优化法 赖松家 四川农业大学动物科技学院 (一)序言 概念: 育种规划最优化 根据特定的育种目标,制定出在多项育种措施上具有不同强度的候选育种方案,通过育种成效标准,如综合遗传进展、育种效益等,进行综合评估,应用系统工程的方法,科学有效地配置资源、技术、方法和措施,筛选出“最优化”(optimization)育种方案。 育种规划最优化主要内容: ①确定育种目标; ②制定候选育种方案: ③育种规划的模型计算,包括估计育种值、遗传参数、经济学参数、生物学参数和育种效益; ④选择优化育种方案; ⑤确定新育种方案、措施的实施。 (二)动物育种规划最优化方法 1、抉择育种目标(breeding objective) 确定育种目标是育种规划最优化的核心工作。适宜的育种目标对群体内选择、选择品种、杂交组合、评估基因效应和育种方案最优化设计都十分重要。 育种目标指使动物生产获得最大的经济效益,包括持久作用于动物生产有经济意义的生产性状或与生产性状相关的次级性状(secondy traits)。 那些与生产性能不相关的体尺外貌性状,或一些并不妨碍使用的外貌缺陷等,在育种过程中都不加以考虑或少加以考虑,如品种的毛色等。 次级性状 繁殖力是重要的综合性状,它对于奶牛育种效益经久地起作用,因此应在确定奶牛育种目标时加以考虑。选定“配妊时间”作为反映繁殖力的性状。 第二个应该包括在育种目标中的性状是使用寿命(或终生胎次)。值得注意的是母牛使用寿命与泌乳期内产奶性能多是拮抗关系,建议采用一个新的表达使用寿命的选择性状—保持力。 评定公牛使用寿命遗传素质的选择性状可用“保持力60”,即公牛的全部女儿中60月龄以上仍在群中生产牛奶的牛只比例。 母牛生产能力作为产奶性能的一个间接性状是不容忽视的,新型的乳成分自动分析仪可以测定牛奶抽样中的体细胞数。当每立方厘米超过500,000个体细胞时,就确定为乳房炎。 2、育种规划中的经济学参数 根据定量经济学原理,综合育种值中的经济加权系数是两个组分之积: Wi=Wi*·ni 其中Wi=性状i的经济加权因子 Wi*=性状i的边际效益 ni=性状i的性状表现贴现值 性状的边际(Marginal profit) 指当性状超过群体均数一个计量单位时,边际产出量与边际投入量之差。 边际效益估计的方法主要有回归法、差额法、单个场最优化模型和区域平衡模型。 差额差是对育种的边际产出量和边际投入量的实际值进行调查并进行经济学评价和计算。其计算公式为: Wi*=ΣARij-ΣACij 式中ARij为性状i的第j个边际产出组分,ACij为性状i的第j个边际投入组分。 (1)性状的边际效益 性状的贴现量(Discount expression peranimal trait)表达了性状在一定的规划期内,通过各种育种措施在育种群和生产群中实现生产性能提高的比例、时间和频率。在一定时间内性状实现的比例越大、时间越早、次数越多,性状的经济价值越大。 采用基因流动法进行计算,计算工作将在育种规划计算专用程序ZPLAN支持下完成。计算公式为: nij=mjt(1+r)-t 其中 nij=选择周期j组i性状的标准化贴现值 D=投资期 hi=性状i的实现向量 (2)性状的贴现量 mjt= t时选择周期j组种畜在各年龄—性别组家畜所占有的基因比例性状向量 r=预算利率 t=从起始点到性状表现时的时间 j=选择周期的家畜组 mjt=Rjat-1+Pmit-1 式中 Rj为第j个选择通径的繁殖矩阵 at为各选择通过t时的年龄向量 P为基因传递矩阵 Mt=Pmt-1 采用育种效益(breeding returns)作为育种规划效率的评价标准,育种效益用经济学的术语称作资本价值,用育种学的术语可称作选择反应。一个投资对象的资本价值是在预定的投资期内经贴现后的产出与投入之差。计算公式为: K0=Σ(et-at)/(1+r)t 其中et=t时产出组分,at=t时投入组分 r=预算利率,D=投资期 K0=育种效益 (3)育种效益 3、遗传进展的传递 (1)遗传进展的传递模型 Ⅰ Ⅱ Ⅲ Ⅳ B B B B ♂ ♀ ♂ ♂♀ ♂ ♂ ♀ R R

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