生物化学-第二章 核酸的结构和功能.ppt

第二章 核酸的结构和功能 Structure and function of Nucleic Acid tRNA的“倒L”型三级结构 反密码子环 反密码子 载运氨基酸 tRNA三叶草型二级结构特点 反密码子环 3`氨基酸臂 在三叶草型二级结构的基础上， 突环上未配对的碱基由于整个分子的扭曲而配成对，目前已知的tRNA的三级结构均为倒L型 一、核酸的基本结构单位：核苷酸(nucleotide) 小结 核苷酸的组成：碱基、戊糖和磷酸。 DNA: 碱基（A T G C），脱氧核糖 RNA：碱基（A U G C），核糖 核苷酸的连接方式： 3?, 5?磷酸二酯键 末端： 5? 端、 3?端 多核苷酸链的方向： 5ˊ端→3ˊ端(由左至右) 二、核酸的基本结构形式 ：多聚核苷酸 （polynucleotide) 三、核酸的一级结构 一、DNA的二级结构 -双螺旋结构模型 （一）DNA双螺旋结构研究的背景 1、 DNA是遗传的物质基础 2、 Chargaff原则 3、 DNA 分子X射线衍射分析 4、 双螺旋结构模型的建立 第二节 DNA的空间结构与功能 1950年前后，Erwin Charggff等人采用纸层析及紫外吸收技术测定了多种生物体DNA的碱基组成。 不同来源的DNA碱基组成（摩尔%） DNA来源 腺嘌呤 胸腺嘧啶 鸟嘌呤 胞嘧啶 人 30.4 30.1 19.6 19.9 绵羊 23.9 28.7 21.1 20.9 公牛 29.0 28.7 21.2 21.2 大鼠 28.6 28.4 21.4 20.4 母鸡 28.0 28.4 22.0 21.6 大肠杆菌 24.7 23.6 25.7 25.7 2、Charggff原则： 所有DNA分子中，A%＝T% G%＝C% （嘌呤碱的摩尔数=嘧啶碱的摩尔数） 有种属特异性：不同生物的DNA碱基组成不同 同一生物体的DNA碱基组成没有组织器官特异性 这预示着碱基互补配对的可能性，即A与T配对， G与C配对。 Erwin Chargaff （1905－1995） 这些结果后来为DNA的双螺旋结构模型提供了一个有力的佐证。 DNA 分子 X射线衍射照片 3、 DNA 分子X射线衍射照片 4、DNA双螺旋结构模型（double-helical structure） James Watson & Francis Crick 1953年，James Watson & Francis 1、螺旋中的两条链反向平行，即其中一条链的方向为5′→3′，而另一条链的方向为3′→5′，两条链共同围绕一个假想的中心轴呈右手双螺旋结构。亲水磷酸、戊糖为骨架，疏水碱基向内； （二）DNA双螺旋结构要点 2、碱基对互补，碱基之间氢键连接，A＝T,G＝C；每个碱基对处于同一平面，碱基平面垂直于中心轴； 由于几何形状的限制，碱基对只能由嘌呤和嘧啶配对，即A与T，G与C。这种配对关系，称为碱基互补。A和T之间形成两个氢键， G与C之间形成三个氢键。 碱基配对和氢键形成 3、双螺旋横截面的直径约为2 nm，相邻两个碱基平面之间的距离（轴距）为0.34 nm，每10个核苷酸形成一个螺旋，其螺距（即螺旋旋转一圈的高度）为3.4 nm。 4、由于碱基对排列的方向性，使得碱基对占据的空间是不对称的，因此，在双螺旋的表面形成大小两个凹槽，分别称为大沟（major groove)和小沟(minor groove),二者交替出现，是蛋白质－DNA相互作用的基础 。 氢键维持 DNA 双链横向稳定性， 碱基堆积力维持双链纵向稳定性(主要）。 2.0 nm 小沟 大沟 离子键 磷酸基团上的负电荷与介质中的阳离子之间形成离子键，减少双链间的静电排斥力。 5.稳定双螺旋