生物学第三章：蛋白质的结构与功能.pptVIP

第三章：蛋白质的结构与功能 吴兰 南昌大学生物技术系 一级结构: 编码蛋白质的氨基酸组成的基因的核苷酸顺序决定 高级结构：二，三，四级结构。主要靠次级键维系，尤其是疏水键 蛋白质的空间结构由一级结构决定，生物学功能由它特定的空间结构决定 第一节：研究蛋白质空间结构方法 X 衍射晶体衍射法 核磁共振光谱法 第二节：蛋白质的二级结构 二级结构：多肽链的主链有规则的折叠方式（多肽链主链的原子在空间上的排列）（不涉及侧链的构像） α-螺旋 β-折叠 β-转角 无规则卷曲 维持二级结构主要为氢键 第二节：蛋白质的二级结构 肽平面;由肽键中的四个原子和与之相 邻的两个碳原子共同构成的刚性平面 （CαCONHCα) 反式结构 α-螺旋（Pauling, 1951) 1）：锯齿形排列 2）：右手螺旋 3.6AA/圈，螺距0.54nm each residue arises 1.5 ? and rotate 100 degrees about the helix axis 3）：氢键维系（链内氢键） 平行长轴 Each carbonyl oxygen of the residue n is hydrogen bonded to the NH group of residue (n+4). 4）：侧链伸出螺旋 β-折叠（与α-螺旋对照） α-螺旋是肽链卷曲的棒状结构， β-折叠处于较伸展的曲折结构 β-折叠比α-螺旋更坚硬和稳定 β-折叠特点 多肽链充分伸展，肽平面折叠成锯齿状 侧链交错位于锯齿状平面的上下方 氢键维系：氢键的方向垂直长轴 有顺平行和反平行结构 β-转角:肽链出现的180o转角 相邻两AA残基形成氢键 无规卷曲: 蛋白质分子中那些没有确定规律性的部分肽链构象 第三节：纤维状蛋白质 第三节：纤维状蛋白质 α-角蛋白——螺旋中的螺旋 烫发的原理 第四节：球状蛋白质及三级结构 三级结构：蛋白质分子中所有原子的三维空间排列，包括它的二级结构要素和侧链在空间上的相互作用。 三级结构的形成使得在序列中相距较远的氨基酸侧链相互靠近。 4）：超二级结构(motif) 结构域：在较大的蛋白质分子中所形成的二个或多个在空间上可明显区别的局部区域。结构域具有独特的空间构象，与分子整体以共价键相连，并承担独特的生物学功能。 结构域与分子整体以共价键相连 具有相对独立的空间构象和生物学功能 同一蛋白质中结构域可以相同和不同，不同蛋白质中的结构域也可以相同或不同 三级结构特点： 4）：次级键维系：疏水键，盐键，氢键，范德华力，二硫键 5）：功能区：表面或特定部位 第五节：寡聚体蛋白质和四级结构 寡聚蛋白中亚基的立体排布及相互作用 亚基(subunit): 寡聚蛋白中单条独立多肽链，具有独立的一 二 三级结构,单独存在时一般无生物学活性. 亚基之间以非共价键相连,亚基可以相同也可以不同. 亚基之间以非共价键相连,包括疏水键(主要),盐键,氢键和范德华力 亚基可以相同和不同 四级结构的对称性(A): 环状对称 (2)二面体对称 （3）其它类型的对称 第六节：蛋白质空间结构与功能的关系 蛋白质一级结构是空间结构和生物功能的基础，一级结构决定空间结构；但一级结构并非决定空间结构的唯一因素。空间结构是生物活性的直接体现。 一：一级结构与功能的关系 1：一级结构的保守序列决定空间结构 （1）不同蛋白质之间的比较：相似结构相似功能，不同结构不同功能 （2）同一蛋白质不同状态比较：一级结构决定空间结构 （3）保守序列，保守氨基酸改变，功能改变，保守氨基酸不变，功能不变 2：一级结构并非影响空间结构的唯一因素 分子伴侣：在蛋白质的折叠，加工形成特定空间构象及穿膜进入细胞器的转位过程中起关键作用的一类蛋白。 与未折叠的肽段（疏水部位）进行可逆结合，辅助二硫键的正确形成。 引导肽段的正确折叠并聚合多条肽链成为较大结构 可以解聚错误聚合的肽段，防止错误发生 二：空间结构与功能的关系 空间结构的特定区域体现生物活性 1：空间结构体现生物特异性 2：空间结构体现生物活性 3：空间结构的灵活性，体现了生物活性的可调节性 4：空间结构并非生物活性的唯一影响因素 5; 蛋白质构象疾病 别构效应：蛋白质分子的特定部位（调节部位）与小分子化合物（效应物）结合后，引起空间构象发生改变，从而促使生物学活性变化的现象。 协同效应：一个寡聚蛋白质的一个亚基与其配体结合后，能影响此寡聚体中另外的亚基与配体的结合能力：包括正协调和负协调效应 别构效应（别位效应、变位效应，allosteric effect）：蛋白质分子的特定部位（调节部位）与小分子化合物（效应物）结合后，引起空