细胞STR鉴定 阻止“STAP细胞”血案重演.pdfVIP

细胞STR 鉴定 阻止”STAP 细胞”血案重演 导读： 自从Nature 发出通知：Nature 旗下杂志将从2015 年5 月开始要求作者鉴 定论文中所用细胞系后，最近看到不少人在咨询细胞STR 鉴定，因此，整理了 相关资料分享给有需要的朋友。 背景： 你是否遇到这样的困扰：新买的细胞，实验室传了几代的细胞，或者在超低 温冰箱冻存几年不用的细胞交叉污染或错误辨识的细胞而导致研究结论错误、结 果不可重复、临床细胞治疗灾难性后果，这浪费大量时间、精力和金钱。据报道 有 1/6 的科学家在研究中使用“假冒”细胞?最近更有文章称：国内建立的人细 [1-6] 胞系竟高达 85%是错的！ 。还记得 2014～2015 年闹得沸沸扬扬的“STAP 细 胞”血案么？日本美女科学家小保方晴子的 “STAP 细胞”，后来证实是污染了 胚胎干细胞。 警惕！以下原因均可导致所用细胞系错误辨识或交叉污染： 因此NIH 、ATCC 、Nature 和 Science 等近年对此多次发出呼吁，要求研究 者对细胞进行鉴定[4,5,7,8] ，如2011 年美国国家标准学会专门颁布了一份细胞STR [9] 鉴定国家标准 ；2014 年 12 月、2015 年2 月Science 杂志分别发表文章专题阐 述细胞交叉污染和错误辨识严重性[10, 11] ；2015 年4 月Nature 通知：Nature 旗下 [12] 杂志将从5 月开始要求作者鉴定论文中所用细胞系 ；2015 年6 月有报道称一 科学家由于用错细胞系，撤销Nature 论文。STR （Short Tandem Repeat ，短串联 重复序列）基因分型已被 ICLAC 、ATCC 等权威机构作为金标准应用于细胞鉴 定[13,14]，目前越来越多的杂志要求在投稿时提供细胞STR 鉴定结果。 已开始要求细胞STR 鉴定的期刊：  Nature;  BioTechniques;  CancerResearch;  CancerDiscovery;  Clinical Cancer Research;  MolecularCancer Research;  CancerPrevention Research;  InternationalJournal of Cancer;  MolecularCancer Therapeutics;  CellBiochemistry and Biophysics;  CancerEpidemiology, Biomarkers Prevention;  In VitroCellular Developmental Biology –Animal;  什么是细胞STR 鉴定？ [15] STR 基因位点由长度为 3～7 个碱基对的短串连重复序列组成 ，这些重复 序列广泛存在于人类基因组中，可作为高度多态性标记，被称为细胞的 DNA 指 纹 （如目前我们亲子鉴定即采用该技术），并可通过 PCR （聚合酶链式反应） 来检测。STR 基因座位上的等位基因可通过扩增区域内重复序列的拷贝数的不同 来区分，在毛细管电泳分离之后可通过荧光检测来识别。随后通过一定的计算方 法[13, 16] ，即可根据所得的STR 分型结果与专业的细胞STR 数据库比对从而推算 出样品所属的细胞系或可能的交叉污染的细胞系名称。这个STR 数据库中包含的 细胞系越全面，其可用性就越大。如ATCC 已有相关的STR 数据库，但其只有 400 多株细胞系的数据，据说国内有公司自己建立了更全面的细胞系STR 数据库， 号称含8000 条数据，并且首次实现对目前研究越来越火的干细胞系进行鉴定。 何时需做细胞STR 鉴定？ 1、发表文章或申请课题经费前； 2、使用细胞进行临床治疗（试验）前； 3、准备冻存保种或已冻存多年的细胞； 4、一个涉及到细胞试验项目开始/结束时； 5、新得到的细胞或实验室培养5 代以上的细胞； 6、细胞系表现不稳定或结果与预期差别较大； 7、异体细胞