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第八章 基因的表达与相关调控(下).ppt
蛋白激酶(PK)分类: 根据底物蛋白质被磷酸化的氨基酸残基种类分: (1)丝氨酸/苏氨酸型 (2)酪氨酸型 (3)组氨酸型 根据是否有调节物参与蛋白激酶活性分: (1)信使依赖型 (2)非信使依赖型 (1). 在胞内介导胞外信号时具有专一应答特点。与信号传递有关的蛋白激酶类主要受控于胞内信使,如cAMP,Ca2+,DG(二酰甘油)等,这种共价修饰调节方式显然比变构调节较少受胞内代谢产物的影响。 (2).蛋白质的磷酸化与脱磷酸化控制了细胞内已有的酶活性。与酶的重新合成及分解相比,这种方式能对外界刺激做出更迅速的反应。 (3).对外界信号具有级联放大作用; (4).蛋白质的磷酸化与脱磷酸化保证了细胞对外界信号的持续反应。 受cAMP水平调控的A激酶 C激酶与PIP2、 IP3和DAG CaM激酶与MAP激酶 酪氨酸激酶途径 蛋白质磷酸化与细胞分裂调控 第四节 蛋白质乙酰化对基因表达的影响 ?? 细胞内的染色质在乙酰化酶(HAT)的催化下,由乙酰CoA提供乙酰基,而被乙酰化修饰。去乙酰化酶(HDAC)催化其脱乙酰化。核小体组蛋白八聚体中,存在32个潜在的乙酰化位点,主要分布在H3和H4,其次为H2A和H2B。 组蛋白乙酰转移酶(HAT) HAT可分布在细胞核(A型)或胞浆(B型)。A型HAT复合物包括GNAT、MYST、p300/CBP、Basal TF、Nuclear Receptor Co-factors五大家族。因此,有些HAT同时也是转录因子或转录共激活因子. 组蛋白乙酰转移酶的分子结构 组蛋白乙酰转移酶超家族 组蛋白去乙酰化酶(HDAC) ? HDAC可分为三大亚家族: Class I —— HDAC1,2,3,8;Class II —— HDAC4 ~7,9~11;Class III —— SIR T1~7 启动子: 核心启动子(core promoter)TATA盒,-25—-30bp 上游启动子元件(upstream promotor elements,UPE):CAAT 盒,-70bp;GC盒等,通过TF II复合物来提高转录效率。 增强子是指能使和它连锁的基因转录频率明显增加的DNA序列。远离转录起始点(1~30kb),增强启动子转录活性DNA序列。 1、增强效应十分明显。 2、增强效应与其位置和取向无关。 3、大多为重复序列,一般长约50bp。 4、 增强效应有严密的组织和细胞特异性。 5、 没有基因专一性。 6、 许多增强子还受外部信号的调控。 增强子的性质 一种观点认为,增强子为转录因子提供进入启动子区的位点。 第二种认为,增强子能改变染色质的构象。因为增强子区域容易发生从B-DNA到Z-DNA的构象变化。 增强子的功能是可以累加的。 增强子的作用原理 概念:为DNA结合蛋白,核内蛋白,可使邻近基因开放(正调控)或关闭(负调控) 通用或基本转录因子(general transcription factors):RNA聚合酶结合启动子所必需的一组蛋白因子。 TFⅡA、 TFⅡB、 TFⅡD、 TFⅡE等 特异转录因子( special transcription factors):个别基因转录所必需的转录因子. OCT-2:在淋巴细胞中特异性表达,识别Ig基因的启动子和增强子。 反式作用因子(trans-acting factor) 从功能上分析其结构可包含有不同区域: ①DNA结合域(DNA binding domain) :多由60-100个氨基酸残基组织的几个亚区组成; ②转录激活域(Transactivation domain) :常由30-100氨基酸残基组成,这结构域有富含酸性氨基酸、富含谷氨酰胺、富含脯氨酸等不同种类,以酸性结构域最多见; ③连接区:即连接上两个结构域的部分。不与DNA直接结合的转录因子没有DNA结合域,但能通过转录激活域直接或间接作用于转录复合体而影响转录效率。 螺旋-转折-螺旋(Helix-turn-helix,H-T-H) 锌指结构(zinc finger) 碱性-亮氨酸拉链(basic - leucine zipper) 碱性-螺旋-环-螺旋(basic – helix /loop /helix,bHLH) DNA结合结构域 是最早发现于原核生物中的一个关键因子,该结构域长约20个aa,主要是两个α-螺旋区和将其隔开的β转角。其中的一个被称为识别螺旋区,因为它常常带有数个直接与DNA序列相识别的氨基酸。 这类结构至少有两个α螺旋,其间由短肽段形成的转角或环连接,两个这样的motif结构以二聚体形式相连,距离正好相当于DNA一个螺距(3.4nm),两个α螺旋刚好分别嵌入DNA的深沟。 螺旋-
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