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第十一章 微生物的分类和鉴定 第一节 微生物的分类单元 第二节 微生物的命名 第三节 微生物的分类依据和方法 第四节 微生物在生物界的地位 第五节 各大类微生物的分类系统纲要 微生物分类:是按M的亲缘关系相似程度把M归入各分类单元或分类群(taxon),以得到一个反映M进化的自然分类系统,可供鉴定用的检索表以及可给出符合逻辑的名称的命名系统。 任务:分类(classification),鉴定(identification)与命名(namenclature) 步骤:(获得纯培养物后) 1.据形态特征鉴别其属于哪一大类(B,A,Y,M)。 2.据其生理生化特征,生态特征,免疫特征和遗传特征等。借助于检索表或鉴定手册来依次确定是属于哪个目,科,属,种。 3.最后与该种的模式种加以比较并命名。 第一节 微生物的分类单元 微生物的分类单元也是种。 微生物种——是显示高度相似性,亲缘关系极其接近,与其他种有明显差异的一群菌株的总称。 具体分类时,常用一个被指定的,能代表这个种群的模式菌株或典型菌株(type stain)作为该种的模式种来定种。 一、种以上的分类单元 二、种以下的分类单元 ㈠亚种(Subspecies,subsp,ssp.) ㈡变种(Variety,var.) ㈢型(form) ㈣菌株(strain),又称品系 ㈤培养物(culture) ㈥居群(population)(群体、种群、群丛) 目前正式分类单元 非正式分类单元 超纲 亚纲 亚目 亚科 族 亚族 域(Domain) 界(Kingdom) 门(Phylum或Division) 纲(Class) 目(Order) 科(Family) 属(Genus) 种(Species) 亚种(Subspecies) 群 、组、 系 种 型、居群、 菌株、培养物 亚种 ㈠亚种(Subspecies,subsp,ssp.)——是种的进一步细分的单元,一般是指在某一个特征上与模式种有明显而稳定差异的菌株。 例:金黄色葡萄球菌的厌氧亚种 Staphylococcus aureas subsp. anaerobius ㈡变种(Variety,var.)(一般认为是亚种的同义词,现不主张使用) 例:蜡状芽孢杆菌的荧光变种 Bacillus cereus var. fluorescens 产黄绿色荧光色素。 ㈢型(form)(曾用作菌株的同义词,现已废除,仅作若干变异型的后缀)。 例:生物变异型(biovar),形态变异型(morphovar),致病变异型(pathovar),噬菌变异型(phagevar)血清变异型(serovar)等。 ㈣菌株(strain),又称品系:一个菌株是指由一单细胞繁衍而来的克隆或无性繁殖系中的一个M或M群体。 ㈣菌株 菌株实为一个物种内遗传多态性的客观反应,几乎是无数的; 菌株强调的是遗传型,因此,一旦菌株发生突变,遗传重组,均应标新菌株名; 菌株与克隆的(即无性繁殖系)的概念相同; 同一种不同株之间,作为分类鉴定的主要性状虽相同,但作为非鉴定用的“小”性状可以有很大差异。(如:生化性状,代谢产物,和产量性状) 菌株的名称都放在学名后面(见后),可随意用字母,符号,编号或混合型等方式自作决定。 一些菌株 Escherichia coli K12 大肠杆菌K12菌株 E. coli O-157:H7 致病性大肠杆菌(O、H表示抗原特征) Escherichia coli B 大肠杆菌B菌株 Bacillus subtilis AS1.398 蛋白酶高产的枯草杆菌 Bacillus subtilis BF7658 α-淀粉酶高产的枯草杆菌 Corynebacterium pekinense AS1.299 谷氨酸高产的北京棒杆菌 Bifidobacterium bifidum ATCC 29521 双歧双歧杆菌的一个模式菌株 ATCC-(Amercian Type Culture Collection) AS-中国科学院(Academia Sinica) BF-北京纺织工业局科学研究所 ㈤培养物(culture):是指一定时间一定空间内微生物细胞群或生长物。 ㈥居群(population)(群体、种群、群丛):是指一定空间中同种个体的组合。每一个物种在自然界中的存在,都有一定空间结构,在其分散的、不连续的居住场所或分布区域内,形成不同的群体单元,这些群体单元称为~。 第二节 微生物的命名 俗名(common name,vernacular n
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