第4章蛋白质的共价结构2.pptVIP

第 4 章 蛋白质的共价结构 （二）C末端测定 羧肽酶 A、B、C和Y四种。 羧肽酶 A 不能水解C末端是Arg或Lys残基的酶； 羧肽酶 B 仅水解C末端是Arg或Lys残基且不与Pro残基相连的酶； （四） 拆开二硫键 2、巯基化合物还原法：β 巯基乙醇 二硫苏糖醇（DTT） 1、过甲酸氧化 （五）多肽裂解 （六）完整肽链顺序的确定 五、蛋白质的一级结构与功能的关系 （一）蛋白质一级结构决定了蛋白质空间构象，而蛋白质空间构象又是功能的基础。 （二）通过比较来源不同物种间类似蛋白质一级结构可以洞悉蛋白质的功能并揭示出这些蛋白质以及产生他们的生物体之间的进化关系。 （三）蛋白质一级结构的分析可以进一步确定遗传性疾病的诊断和治疗方法。 （一）蛋白质一级结构决定了蛋白质空间构象，而蛋白质空间构象又是功能的基础。 蛋白质前体 （无活性） 活性蛋白质 酶切 无活性的蛋白质前体转变成有活性的蛋白质，需要相应结构改变。 Eg.蛋白质前体与一级结构的关系 （二） 蛋白质一级结构与功能的洞悉和种属差异的关系 保守序列： 对蛋白质空间构象及功能活性部位非常重要的氨基酸序列是不变的。 种属来源不同而功能相同的蛋白质称为同源蛋白质。 同源蛋白质一级结构存在某些差异。但与功能相关的结构（保守序列）总是相同的。 * * 一、蛋白质通论 （一）什么是蛋白质 （二）蛋白质的化学组成和分类 化学组成 蛋白质化学组成特点 分类 单纯蛋白质（ simple protein) 结合蛋白质 (conjugated protein) 蛋白成分仅由氨基酸构成，不含其他成分。 如清蛋白、组蛋白 蛋白成分含有除氨基酸以外的各种化学成分作为其结构的一部分。 如糖蛋白、金属蛋白 （三）蛋白质分子的形状和大小 形状和溶解度 球状蛋白质： 功能蛋白 大多属于水溶性蛋白质, 是生物活性蛋白. 纤维状蛋白质： 结构蛋白 大多属于水不溶性蛋白质, 在生物体内具有保护、连接和支撑的作用. 蛋白质多肽链的大小 40个Aa残基。 数千Aa残基。（100~1000个Aa残基） 大小 组成 常见氨基酸残基：亮氨酸、丙氨酸、甘氨酸等。 稀有氨基酸残基：色氨酸、半胱氨酸等。 相对分子量= Aa残基数 X 110 （四）蛋白质功能的多样性 二、肽（peptide) （一）肽和肽键的结构 肽键（peptide bond)：在两个氨基酸之间产生的酰胺键，称为肽键。 C N O H 肽（peptide) ：两个氨基酸借一个分子所含的氨基与另一个分子所含羧基脱水缩合成最简单的肽，即二肽。同理，三个氨基酸脱水缩合成三肽。 寡肽（oligopeptide): 二十个以内氨基酸连接成的小肽，称为寡肽。 多肽（polypeptide): 二十个以上氨基酸连接成的小肽，称为多肽。 多肽链（ polypeptide chain): 多肽分子中氨基酸通过肽键相互衔接形成的长链，称为多肽链。 多肽链的结构模式 氨基末端（amino-terminal):多肽链中自由氨基的一端(或N末端）。 羧基末端（carboxyl-teiminal): 多肽链中自由羧基的一端（或C末端）。 短肽： N末端 C末端 氨基酸残基（residue): 肽链中氨基酸分子因脱水缩合而不是完整的氨基酸分子，故称为氨基酸残基。 三字母缩写：Ala-Tyr-Asp-Gly 单字母缩写：AYDG 多肽的命名 (二）寡肽的物理和化学性质 两性解离特性 1、肽链中氨基酸残基的pK值与游离氨基酸的 pK值不同； 2、静电荷为零时溶液的pH值是该肽溶液的等电点 （pI）； 3、 环境pH ＞pI 该肽分子带负电荷 环境pH ＜ pI 该肽分子带正电荷 R CH COOH NH2 R CH COO- NH3+ －H+ R CH COOH NH3+ R CH COO- NH2 阳离子 pH pI 氨基酸的兼性离子 pH = pI 阴离子 pH pI 氨基酸具有两性解离的特性 －H+ ＋H+ ＋H+ 显色反应 茚三酮反应；双缩脲反应等 紫外吸收特性和旋光异构性 （三）天然存在的生物活性肽 自然界中某些寡肽，具有重要的生物学活性。 肽类激素：催产素，加压素； 神经肽：脑啡肽； 抗生素肽：短杆菌肽，博来霉素； 谷胱甘肽的功能： GSH的 “-SH”具有还原性， 从而阻断这些化合物与DNA、RNA或蛋白质结合，以保护机体免遭毒物损害。 蛋白质的分子结构 （三维结构或空间构象） (prim