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(4)采用一定的筛选模型进行筛选(最好能利用平板培养初筛) (5)如何将微生物的代谢产物与平板技术相结合,高效地初筛工业微生物菌株? (7)菌种筛选培养基的一般成分有哪些? (1) 分类及菌种鉴定基本知识 ①种以上的系统分类单元 界 Kingdom 门 Phylum(或Division)——亚门 纲 Class ——亚纲 ——超目 目 Order ——亚目 科 Family ——亚科 ——族 ——亚族 属 Genus 种 Species ②种的概念 定义:种是一个基本分类单位,是一大群表型特征高度相似、亲缘关系极其接近、与同属内其他种有明显差异的菌株的总称。在微生物中,一个种只能用该种内的一个典型菌株作为具体标本,它就是该种的模式种。 新种: sp.nov.或nov. sp.,新被鉴定的种发表时应在其学名后标上sp.nov.的符号,新种发表前应将其模式菌株的培养物存放在一个永久性的保藏机构,并应允许人们从中取得。 ③微生物的命名 命名:菌种的科学名称。菌种的学名是按照《国际细菌命名法规》命名的国际学术界公认,并通用的名称。 命名原则: 学名=属名+种的加词+(首次定名人)+现名定名人和现名定名年份 规定与常识:属名应大写首字母、单数、可以组合而成。种的加词代表一个种的次要特征,首字小写。 亚种(subspecies): 种的进一步细分,一般指其某一方面稳定的特征与模式 种不同的种常在种名、署名的加词后写上subsp.然后再 写具体亚种的加词; 变种( variety): 容易引起混乱; 型(form): 使用中用型作为后缀;表示细菌菌株,现已作废; 类群(group): 没有分类地位非正式地指定一组具有某些共同性状的生物; 菌株(strain): 表示任何由一个独立分离的单细胞繁殖而成的纯种群体极 其一切后代;实际上是一个微生物达到遗传性纯的标志。 (2)菌种分类鉴定主要步骤 纯化、 测定一系列必要的指标:各大类有各自重点指标,真菌以形态为主,酵母和放线菌则以形态与生理兼用,细菌较多使用 生理指标。 查找权威性鉴定手册: [鉴定技术四个水平:细胞形态和习性水平, 细胞组分水平,蛋白质水平,基因或DNA水平] 原核生物分类系统纲要——伯杰氏系统细菌学手册 真菌界分类系统很多,各国采用不同的系统,比较混乱。近年来为较多人接受的是Ainsworth的纲要。 微生物数码分类表(统计分类法) ③数值分类法 即统计分类法:在200年前M. Adanson(1727-1806,法国植物学家)发表的分类原理基础上结合现代计算机技术发展而来的。 定义:通过广泛比较分类单位的性状特征,然后计算它们之间的相似性,再根据相似性的数值划分类群的一种分类方法。 主要观点: 在一个分类群中,其所含信息量越大,即分类所依据的性状越多,其分类效果也越好; 顺序建立自然分类单元时,每个性状都是等权的; 任何两分类实体间的整体相似性,都是由每一对的相似性计算而来的;能够由类群间相似性的差异识别不同的分类实体; 如果给予有关进化途径和机制的某些假定,可以从组群的分类学结构或从性状相关上作出种系发生的推论; 分类学应作为一门经验科学来看待和实践; 数值分类学是以表象相似性为基础的。 举例:蜜柚脱苦酶产生真菌鉴定 8天,表面恢复苍白色,由于培养基中溶出的色素增多,使得培养基背面呈深褐色。菌丝体表面会出现粉状的颗粒,所以判断其繁殖器官为分生孢子或粉孢子,菌丝体绒毛状 过氧化氢酶(接触酶)试验 细胞色素氧化酶测定 细胞色素氧化酶是氧化酶的一种,人们习惯将其称为氧化酶。所以在细菌分类鉴定中所说的氧化酶就是指细胞色素氧化酶。氧化酶在有O2和细胞色素C存在时,可氧化对氨基二甲基苯胺,使其呈玫瑰色至暗紫色,在此基础上还能与α-苯酚结合而出现蓝色。 未出现红色或蓝色,可判断为阴性。 鉴定小结 分离到了能分解纤维素的细菌,得到了纯培养。 细菌时革兰氏阴性菌,菌落特征粉红色或浅黄色,好氧型,过氧化氢酶阳性,细胞色素氧化酶阴性,对照《伯杰氏手册》可初步判断分离出的菌种是噬纤维菌属。 下一步应提取16sRNA,根据16sRNA的序列特征确定该菌的归属直至确定种; (4)细菌鉴定方法 ①细菌常规鉴定 形态及生理生化鉴定 蛋白质水平鉴定(免疫诊断、蛋白质图谱分析) (5)酵母菌的鉴定 ①经典的酵母鉴定方法 ②试剂盒及自动化检测 ③酵母酶谱检测 ④酵母的分子鉴定 (6)丝状真菌的鉴定 ①形态学鉴定 是否有性生殖
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