Lec 1-生物信息学.pptVIP

生物信息学Bioinformatics 生物信息学 赵国屏 等 编著 科学出版社 基础生物信息学及应用 蒋 彦 等 编著 清华大学出版社 　 　 生物信息学讲课 24 学时 生物信息学上机实践 8 学时 （机房B座，上机时间另定） 　　 　 上机考核：30％ 闭卷考试：50％ 课堂表现及出勤：20％　　 　 第一章 生物信息学：导论 一、生物信息学的兴起 二、什么是生物信息学 三、生物信息学的研究现状和发展趋势 四、生物信息学研究和发展中的交叉学 科和大学科的特点 一、生物信息学的兴起 美国的三个国家计划： 曼哈顿原子弹计划 (Manhattan Project, 1942 – 1945) 阿波罗登月计划 (The Apollo Program, 1963 - 1972) 人类基因组计划 (Human Genome Project, HGP, 1990 - 2003) The Human Genome Project人类基因组计划 1985: 美国科学家提出 1990: 美国国家卫生院与能源部启动 目标: 给人类基因体测序,即对人体细胞核中30亿个碱基对和10万个结构基因作定位描图，并阐明功能、序列位置、排列组合方式、重组及变异的某些规律，从而破译人类的全部遗传密码 参与:美国、德国、日本、英国、法国和中国 2003:人类基因组DNA的测序准确结果在《自然》与《科学》杂志相继发表 ，公布了基因的数目、分布特点等人类基因的面貌 人类基因组的公众智慧财产原則 智慧财产属于公众 工程中所取得的数据以及相关信息 快速上载于互联网的资料库中 无约束供任何人下载 人类基因组给我们什么？ 生物演化 分子演化、亲缘树、生物共同祖先 基因与疾病 基因晶片、数理分析 蛋白质结构 物理实验、理论模型、计算模擬 蛋白质（群）组织与功能 疾病预防及治疗 基因改良、农作物 药物设计 蛋白质与大分子的结合 Biological Data（生物数据） Genomes （基因组） DNA Sequences of A, T, C, G Annotated with function, “interesting” features Proteins （蛋白质） Amino Acid Sequences Sequences of 20 letters Annotated with structure, function, etc. Biological Data （生物数据） Gene Expression Dynamic behavior of genes Protein Expression Dynamic behavior of proteins Structural Features RNA and proteins … How many characters are in the “Heaven Book”? 3*109 10,000 books 1 book 100 pages 1 page 3,000 characters CCGGTCTCCCCGCCCGCGCGCGAAGTAAAGGCCCAGCGCAGCCCGCGCTCCTGCCCTGGGGCCTCGTCTTTCTCCAGGAAAACGTGGACCGCTCTCCGCCGACAGTCTCTTCCACAGACCCCTGTCGCCTTCGCCCCCCGGTCTCTTCCGGTTCTGTCTTTTCGCTGGCTCGATACGAACAAGGAAGTCGCCCCCAGCGAGCCCCGGCTCCCCCAGGCAGAGGCGGCCCCGGGGGCGGAGTCAACGGCGGAGGCACGCCCTCTGTGAAAGGGCGGGGCATGCAAATTCGAAATGAAAGCCCGGGAACGCCGAAGAAGCACGGGTGTAAGATTTCCCTTTTCAAAGGCGGGAGAATAAGAAATCAGCCCGAGAGTGTAAGGGCGTCAATAGCGCTGTGGACGAGACAGAGGGAATGGGGCAAGGAGCGAGGCTGGGGCTCTCACCGCGACTTGAATGTGGATGAGAGTGGGACGGTGACGGCGGGCGCGAAGGCGAGCGCATCGCTTCTCGGCCTTTTGGCTAAGATCAAGTGTAGTATCTGTTCTTATCAGTTTAATA