第4章 DNA到蛋白质.pptVIP

* 肽酰转移酶中心 移位 延伸 GTP酶中心 23S rRNA的二级结构（ * 5S rRNA的二级结构 第四节 蛋白质的合成 一、 肽链合成的起始 1.?原核生物： （1）起始密码子为AUG，GUG；在原核生物细胞中有两种tRNA可以携带甲硫氨酸，一种被用于起始肽链合成，另一种被用于识别肽链中间的AUG序列。在细菌和线粒体中，起始tRNA携带一个甲酰化的甲硫氨酸，形成N-formyl-methionyl-tRNA，用fMet-tRNAf表示。识别内部AUG密码子的tRNA标记为tRNAm，它的甲硫氨酸不能被甲酰化。 * 由于没有游离的氨基，不能插入到肽链内部。 （2）原核生物mRNA与核糖体的识别信号是S-D序列（Shine-Dalgarno序列），在mRNA上起始密码子AUG上游方向4~13核苷酸之前有一段富含嘌呤的序列，其保守序列为5‘-AGGAGG-3’，这一序列叫S-D序列，它能够与16SrRNA 3’端的富含嘧啶的序列互补结合，正好使30S亚基上的部分P位对准起始密码子AUG以便携带甲酰甲硫氨酸的起始tRNA进入P位。 （3）在肽链合成起始时，首先是核糖体小亚基与mRNA上的核糖体结合位点识别，形成起始复合体。然后，大亚基与小亚基结合，形成完整的核糖体。在肽链合成起始时还需要一些起始因子(IF)。 * 起始因子 蛋白质合成的启动必须有起始因子参加，形成核糖体- mRNA- tRNA三元复合物。 起始因子：蛋白质合成起始阶段特异地与小亚基结合的蛋白质。 * IF-3 为30S特异地结合在mRNA起始位点所需； IF-2 结合于起始tRNA，控制其进入核糖体； IF-1 作为起始复合体一稳定因子，没有专一功能，只能促进IF-2 及 IF-3 的活性，有些原核生物无IF-I。 * 50S亚基加入，释放起始因子。 形成30S-mRNA复合体； IF-2-GTP加入，结合在P位点； 起始tRNA加入；IF-2保证只有起始tRNA参与起始反应； * * [去甲酰酶] [氨肽酶] 合成起始后甲酰甲硫氨酸的处理 细菌新合成蛋白以甲酰甲硫氨酸起始，随后的合成中，甲酰基被去处；有时则去处整个甲硫氨酸。 2.真核生物 （1）在真核生物中，起始密码子是AUG。起始的甲硫氨酸不甲酰化。但也存在2个tRNA分子，分别识别起始AUG或中间的AUG，一般记为 tRNAi和 tRNAm 。 （2）真核生物的起始复合物并不是在起始密码子AUG 处形成，而是首先在mRNA的5’端形成，识别信号是5’末端的帽子结构。在帽子处形成的起始复合物沿mRNA移动，直到发现起始密码子AUG，60S亚基结合上来形成80S核糖体。真核生物的起始因子更多，用eIF表示。 * 多基因mRNA中，核糖体可分别结合在各基因起点以起始合成。 * 延长因子 蛋白质合成中，每向肽链中加入一个氨基酸时，与核糖体周期性结合的蛋白。 EF-Tu：帮助氨酰-tRNA进入A位点； EF-Ts：使 EF-Tu 恢复活性； EF-G： 参与核糖体移位。 二、肽链的延伸 1. 转肽和肽键的形成 在形成完整的核糖体后，P位是一个肽酰tRNA，A位是空的。除了起始f-Met-tRNAf之外，任何氨酰tRNA都可以进入A位，延长肽链。氨酰tRNA进入A位需要一种延长因子EF-TU。另一种延长因子EF-TS主要负责活化EF-TU。当氨酰tRNA进入A位后，在肽酰转移酶的作用下将P位tRNA上的肽酰转移到A位上的氨基上，使肽链延长一个氨基酸。 * EF-Tu-GTP将氨酰-tRNA带入A位点，然后以EF-Tu-GDP离开； EF-Tu唯一不能识别的tRfMet-tRNAf 2. 转位（translocation） 在肽键形成后，EF-G和GTP才能够结合上来共同作用使肽酰tRNA从A 位转移到P位，同时将原来P位上空载的tRNA逐出核糖体，A位重新空出，供下一个氨酰tRNA进入。这时，核糖体已向前移动了一个三联体密码子。 3. 两类延伸因子的交替作用 只有EF-Tu离开核糖体以后，EF-G和GTP才能结合上来；同样，只有EF-G离开核糖体后，新的氨酰基-tRNA三元复合物才能进入A位。两种延伸因子就能交替地与核糖体发生相互作用，使肽键合成和转位作用有条不紊地进行。 4. Ts循环 延伸因子EF-Ts的作用就在于使使用过的EF-Tu.GTP能够转变为有用的形式。 * EF-G：含量高，数量基本与核糖体相同； EF-G与EF-Tu 不能同时和核糖体结合； 二者在核糖体接受新氨酰-tRNA、生成肽键和核糖体移位的循