2010级研蛋白质组学6h1224-27-2.pptVIP

蛋白质组学 目录 一、 蛋白质组学概念 二、蛋白质组学研究背景和意义 三、蛋白质组学研究的策略和范围 四、蛋白质组学研究技术 1、双向电泳(2 -DE) 2、质谱鉴定技术 3、蛋白质数据库 4、酵母双杂交技术 五、蛋白质组学研究的应用及发展趋势 一、蛋白质组学概念 蛋白质组学 proteomics 定义1： (生物化学与分子生物学） 阐明生物体各种生物基因组在细胞中表达的全部蛋白质的表达模式及功能模式的学科。包括鉴定蛋白质的表达、存在方式(修饰形式)、结构、功能和相互作用等。 定义2: (细胞生物学） 研究基因组编码的全部蛋白质的结构、性质和功能的学科。 定义3： (遗传学） 研究细胞内全部蛋白质的组成、结构与功能的学科。 所属学科： 蛋白质组学(proteomics) 指应用各种技术手段来研究蛋白质组的一门新兴科学，其目的是从整体的角度分析细胞内全部的动态变化着的 （1）蛋白质组成成份、表达水平 （2）蛋白质修饰状态 （3）蛋白质之间相互作用与联系， 从而揭示蛋白质功能与细胞生命活动规律。 二、蛋白质组学研究背景与意义 产生背景基因组时代 1、基因组学 基因组学这一名词是美国人T·H·Rodehck在1986年7月造出来的，与一个新的杂志—— genomics一道问世。基因组学完全改变只能研究单个基因的状况，它着眼于研究并解析生物体整个基因组的所有遗传信息。 对应于基因组的所有蛋白质构成的整体，不是局限于一个或几个蛋白质。 同一基因组在不同细胞、不同组织中的表达情况各不相同 。 在空间和时间上动态变化着的整体。 多个蛋白质参与，交织成网络 蛋白互作图谱 1997年召开了第一次国际“蛋白质组学”会议 1998年在美国旧金山召开了第二届国际蛋白质组学会议 1999年1月在英国伦敦举行了应用蛋白质组会议 我国也于1998年启动了蛋白质组学研究，在中科院上海生物化学研究所举办了两次全国性的蛋白质组学研讨会 2003成立了中国人类蛋白质组组织（CHHUPO），并分别于2003年9月、2004年8月以及2005年8月召开了中国蛋白质组学首届、第二届及第三届学术大会，2004年10月在中国北京召开了第三届国际蛋白质组学会议 吸血虫蛋白质组学研究 蛋白质组学的研究意义 蛋白质组学技术的发展使我们很快能确定疾病（如癌症）的起因 蛋白质研究分析速度的提高使生命科学的研究工作更深入、更准确、更快速，更接近生命的本质。 从更深层次上去揭示生命活动的规律， 蛋白质组学研究必将对人类生活质量的提高和人类寿命的延长起到巨大作用。 但蛋白质组研究更为复杂和困难： 蛋白质数目大大超过基因数目。 蛋白质随时间和空间而变化。 三、蛋白质组学研究的策略和范围 两种研究策略 1 “竭泽法” 采用高通量的蛋白质组研究技术分析生物体内尽可能多乃至接近所有的蛋白质 2 “功能法” 研究不同时期细胞蛋白质组成的变化，寻找蛋白质在不同环境下的差异表达 两条研究路线 1 、 蛋白质的表达模式研究路线（Expression profile） 从整体的角度分析细胞内动态变化的蛋白质组成成份、表达水平等， 主要方法：双向凝胶电泳、质谱技术等 2 、蛋白质的功能模式研究路线 蛋白质-蛋白质相互作用研究及蛋白质翻译后修饰研究已成为蛋白质组功能研究中的重要部分 主要方法：酵母双杂交、修饰研究技术等 国家生物医学中心质谱实验室 二维电泳（双向凝胶电泳2-DE）概念 二维聚丙烯酰胺凝胶电泳技术结合了等电聚焦技术(根据蛋白质等电点进行分离)以及SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳技术(根据蛋白质的大小进行分离)。这两项技术结合形成的二维电泳是分离分析蛋白质最有效的一种电泳手段 双向凝胶电泳流程图 质谱技术（ Mass SPectrometry） 是带电原子、分子或分子碎片按质荷比（或质量）的大小顺序排列的图谱。质谱仪是一类能使物质粒子高化成离子并通过适当的电场、磁场将它们按空间位置、时间先后或者轨道稳定与否实现质荷比分离，并检测强度后进行物质分析的技术。 质谱技术可用于： 1、多肽、蛋白质质量测定 2、肽指纹图谱测定