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- 2018-05-23 发布于重庆
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主基因多基因混合遗传模型分析步骤
有同学来问如何运用遗传模型来做遗传分析,虽然这种分析在今天看来,但是还是,所以我把个人使用的心得小结出来,与大家交流分享。
遗传模型这个软件可以对单个分离世代进行分析,也可以对多个世代进行联合分析。
分析可以分为一步法和两步法。
这个软件都是D命令,每个不同分析群体都有各自的分析程序,使用时要依据自己的群体类型选择适合的小程序。
现在,仅以F2单独世代的一步法分析为例说明:
一 数据准备
首先,建立一个TXT文件。比如a.txt
将F2群体每个单株的数据输入txt文件中,可以不必有编号,仅用数据即可。如下为F2群体的穗粒数数据文本文件格式。
选择应用程序F2_1
双击程序图标,打开,然后按照提示,依次输入期望值(0.0001),群体大小(你自己的群体单株数),文件名及所在路径(F2_1.txt)。(一定注意输入正确路径及文件的名称及后缀)回车即开始运行。运行后的数据自动存在该应用程序的同一文件夹下。
下图为程序对话:
程序正在运行中。。。
下图为运行的结果文件
结果文件中各项内容的说明
文件中共有模型A_0,A_1,A_2,A_3,A_4,B_1...到B_6。
现以一个模型(B_1)为例,说明各项的含义。
这是B_1的输出内容:
model B_1 The esp value = 0.000100
mean[1]=94.032539 mean[2]=73.406349 mean[
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