蛋白质合成――翻译.pptxVIP

第一节 翻译概述;密码子的意义并不是单独由mRNA决定的，而是由mRNA和携带氨基酸的tRNA相互作用所决定的 tRNA分子上的反密码子与其相应的氨基酸之间并无结构上的相关性，而且tRNA分子本身并不能催化相应氨基酸的荷载，而是需要相应的氨酰基-tRNA合成酶来催化 ;氨酰基-tRNA合成酶又是如何识别它的两个底物的呢？对于氨基酸来说,是识别它们的侧链基团;而对于tRNA分子来说,每个tRNA分子上有一个特异的小区以供其氨酰基-tRNA合成酶所识别,这就是tRNA分子上的副密码子 荷载相应氨基酸的tRNA分子并不能独立地与mRNA发生作用,因为单靠密码子与反密码子三个碱基对之间的氢健联结是无法保证配对精确性的,更无法形成肽键并促成肽链的起始、延伸和终止。因此,需要核糖体和有关因子的存在 ;mRNA 含有一系列密码子(Codons),这些密码子同氨酰-tRNA的反密码子(AntiCodon)相互作用,使相应的氨基酸掺入到肽链中 核糖体提供一个控制mRNA与氨酰-tRNA相互作用的环境,它像一个沿着模板前进的移动工厂,快速地重复合成肽键的循环 氨酰-tRNA以惊人的速度进出核糖体，卸载下氨基酸；延伸因子(Elongation factor)反复的与核糖体结合、解离。在这些辅助因子(Accessory factors)的共同参与下核糖体完成蛋白质合成的全过程。;第二节 mRNA和tRNA;由于有61个密码子分配给20种氨基酸，因此出现了由多种密码子(最多为6种)编码一个氨基酸的现象，这称为密码子的简并性（degeneracy）。 定义同一个氨基酸的几个密码子称为同义密码子（synonym）,如UUU和UUC是Phe的同义密码子，而Ser是同义密码子UCU、UCC、UCA、UGG、AGU和AGC编码的。 事实上，当密码子的第一和第二个核苷酸完全相同时，第三个核苷酸无论时胞嘧啶还是尿嘧啶，均编码相同的氨基酸。;中文名称;每条mRNA的蛋白质编码区由连续的、不交叉的、称作可读框(open-reading frame, ORF)的密码子串组成。每个ORF对应一个蛋白质，其起始和终止点都位于mRNA内部，即ORF的终止点不同于mRNA的终止点。 翻译起始于ORF的5′端起点，一个密码子一个密码子的通向3′端终点。第一个和最后一个密码子分别称为起始密码子(start codon)和终止密码子(stop codon)。;细菌中，起始密码子通常为5′-AUG-3′,但5′-GUG-3??和5′-UUG-3′也使用；真核细胞总是使用5′-AUG-3′为起始密码子。起始密码子有2个主要功能，第一，指定掺入到增长的多肽链中的第一个氨基酸；第二，确定了所有后续密码子的可读框。由于密码子是一个一个，而且由三个核苷酸组成，一旦翻译开始，每一后续的密码子总是立即紧接着（但不重叠）前一个密码子，这样，通过固定第一个密码子的位置，起始密码子决定了所有后续密码子的位置。 终止密码子有3个，5′-UAG-3′、5′-UGA-3′和5′-UAA-3′，它们决定了可读框的终点，并发出终止多肽合成的信号。;对可读框含义的理解：它是一段连续的密码子，以特定的框架（由第一个密码子决定）来“阅读”，该框架对翻译是开放的，因为它没有终止密码子（即，直到ORF的最后一个密码子）。 mRNA包含至少一个ORF。每条mRNA的ORF数量在真核和原核细胞中有区别：真核细胞的mRNA几乎都只有一个ORF，而原核细胞的mRNA经常含有2个或多个ORF，因此编码多个肽链。 含有多个ORF的mRNA称作多顺反子mRNA，只编码一个ORF的mRNA称作单顺反子mRNA，多顺反子mRNA常常编码功能相关的蛋白质。;4、密码子的一般特征 （1）兼并性 （2）密码子中不同碱基的重要性：密码子中前2个碱基决定了密码子的特异性，第3个起到辅助作用，一个显而易见的规律是，当一个密码子的第1和第2个碱基均为G或C，第3个位置上的碱基无论是4个中的哪一个，均编码相同的氨基酸；但当第1和第2个碱基均被A或U占据时，第3个位置上的碱基对蛋白质的编码就会产生影响 （3）通用性：除线粒体外，真核和原核生物密码子体内体外通用 （4）密码子阅读方向为5′→3′，与RNA合成方向一致;精氨酸有六种编码同义密码子（AGA，CGT，CGC，CGA，CGG，和AGG）。但是在酵母基因组中，精氨酸的48%由密码子AGA确定，而其余五种编码精氨酸的同义密码子则以较低的大致相等的频率被使用（每种10%左右）;果蝇以完全不同的密码子使用偏性编码精氨酸，即比起其它五种选择（每一种的出现频率约为13%）来说，果蝇更倾向于使用密码子CGC（33%）。 某一物种或某一基因通常倾向于使用一种或几种特定的同义密码子，这些密码子被称为最优密码子(Opti