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原子力显微镜对生物大分子的研究 谭琰
摘 要
对生物大分子立体结构和形态的认识是我们进一步了解其功能和探讨生命现
象的重要基础。原子力显微镜(AFM)测定具有高分辨率和直观可视化的特点,它
的样品制备简单,不需要经过脱水、抽真空、染色、包埋等这些会使生物分子结
构发生一定改变的复杂处理过程,并可对生物分子在近生理条件下检测它们的动
态结构信息。这些特点使得它成为研究生物大分子的结构及对其功能影响方面理
想的分析检测工具。因此,自诞生之日起,就被迅速应用到了生物学领域。
本论文利用 AFM 对细胞色素 C 分子的形态和积聚过程进行了观察,并对核酸
分子探针(铬天青 S、溴酚蓝)-十六烷基三甲基溴化铵-脱氧核糖核酸这两个体
系的作用方式和共振光散射法对核酸的测定机理进行了研究,其内容主要体现在
以下三个方面:
1. 用 AFM 对不同浓度溶液中细胞色素 C 分子的存在形态,以及加入降聚剂和
变性剂脲后细胞色素 C 分子的形态变化进行了研究。结果显示,低浓度溶液中细
胞色素 C 分子主要以类球形单体形式存在。浓度较高时,细胞色素 C 分子发生聚
集,在一定浓度范围内,细胞色素 C 的聚集体随着浓度的提高而增大。加入较高
浓度的脲,对细胞色素 C 的聚集具有明显的降聚作用。对单体和聚集体的三维尺
寸进行了测量和分析。
2. 用AFM 对细胞色素C 在温水浴中的积聚过程以及一些外部因素对积聚作用
的影响进行了研究,对细胞色素 C 积聚的不同阶段形成的积聚物形态进行了观察。
结果表明细胞色素 C 分子间有着较强的相互作用,能自发地在水溶液中进行积聚,
形成有规则的螺旋状纤维积聚体。并且其积聚过程受外部环境因素的影响较大,
一定浓度盐离子的存在对细胞色素 C 的积聚具有协同效应。对细胞色素 C 蛋白的
积聚机理和积聚模型进行了探讨。
3.用原子力显微镜(AFM)考察了有机分子探针铬天青 S(chrome azurol S,
CAS)-表面活性剂十六烷基三甲基溴化铵(CTMAB)-脱氧核糖核酸(DNA)以及溴
酚蓝(Bromophenol blue,BPB)-CTMAB-DNA 两种核酸测定体系的作用方式,以此
探讨了这两种体系的共振光散射法测定核酸的机理。结果表明 CTMAB 和有机探针
分子(CAS 或 BPB)与核酸的作用方式主要是静电聚集作用。共振光散射法对核酸
的测定原理是基于有机分子以核酸为模板,由于静电作用在其表面聚集,形成核
酸的超分子化合物。发现 DNA 分子的状态改变是影响有机分子的聚集和共振散射
光强度的主要因素,也是影响核酸测定灵敏度的主要内在原因,线性双螺旋形态
的 DNA 分子能够较好地诱导有机分子在其表面的聚集,产生较强的共振散射光。
关键词:原子力显微镜;细胞色素 C;分子形态;积聚;核酸;共振光散射
I
原子力显微镜对生物大分子的研究 谭琰
Abstract
Our knowledge on three-dimension structures and states of biomolecules is the
important foundation for further understanding molecular functions and life
phenomena. Atomic force microscope (AFM) detection advantages include high
resolution and visualization. The samples’ preparation is very simple. There is no
complex samples’ disposal processes required, such as dehydration、vacuumiz
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