新冠状病毒的实验室检测.pptxVIP

冠状病毒（coronavirus) 概述： 1933年，Baudette等描述了鸡的“哮喘病”，1937年首次从小鸡体内分离出冠状病毒，分离的病毒被鉴定为传染性支气管炎病毒(Infectious bronchitis,IBV); 1951 年，Gledhill等分离出鼠肝炎病毒(Murine hepatitis virus,MHV)； 1965年，Tyrrell和 Bynoe首次在体外用人胎鼻和气管培养方法，从普通感冒病人鼻洗液中分离出一株病毒，命名为B814病毒。 ;1966年， Hamre 和Procknow用人胚肾细胞分离到类似病毒，代表株命名为229E病毒。 1967年，Mclntosh等用人胚气管培养从感冒病人中分离到一批病毒，其代表株是OC43（OC代表 organ culture）。随后证明，OC和229E病毒。 1968年， June Almeida和Tyrrell对这些病毒进行了形态学研究，电子显微镜观察发现这些病毒的包膜上有形状类似日冕的棘突，故提出命名这类病毒为冠状病毒。 1975年，国际病毒命名委员会（International Committee on the Taxonomy of Viruses,ICTV）正式命名了冠状病毒科（coronaviride) 致病性：人冠状病毒常引起 1)普通感冒、是轻型感染。 2)腹泻或胃肠炎。3）下呼吸道感染或肺炎;; 中国大陆 全中国 全世界 发病 5327 发病 7429 发病 8096 死亡 349 死亡 685 死亡 774 ;;冠状病毒 NL63 van der Hoek et al., 2004. Nat. Med. 10:368-373;冠状病毒 HKU1 Woo et al., 2005. J. Virol. 79:884-895;北京儿童医院重症下呼吸道·感染·婴幼儿呼吸道病毒的检测;发热呼吸道症候群病原谱构成及其流行规律;2012中东出现的新型冠状病毒;Fig. Phylogenetic analysis based on 1a gene of coronaviruses and the new novel coronavirus;London1与Bat-CoV-HKU5序列比对;London1与Bat-CoV-HKU4序列比对;Examples of bats and birds from which novel coronaviruses were discovered. ;A model of coronavirus evolution;急性呼吸道感染诊断;病毒分离: 金标准 抗原检测: 迅速，敏感; 潜伏期 1-12 天,平均 5-6 天,潜伏期内无传染性, 发病 即有传染性 若将一个传染周期定在 5-6 天(平均潜伏期), 发病 5 天内能确诊病人, 则可能将疫情有效控制在 2 代病人以内 ; 1．SARS诊断分类与标准 （1）疑似病例：对于缺乏明确流行病学依据，但具备其它SARS支持证据者，如临床表现和肺X线变化等，可以作为疑似病例，需进一步进行流行病学追访，并安??病原及血清学检查以求印证。对于有流行病学依据，有临床症状，但尚无肺部X线影像学变化者，也应作为疑似病例。 （2）临床诊断病例：对于有SARS流行病学依据、相应临床表现和肺部X线影像改变，并能排除其他疾病诊断者，可以作出SARS临床诊断。 （3）确定诊断：在疑似和临床诊断的基础上，若分泌物或血清SARS-CoV RNA检测阳性，或血清（或血浆）SARS-CoV特异性N蛋白抗原检测阳性，或血清SARS-CoV抗体阳转，或抗体滴度4倍及以上增高，则可做出确定诊断。;呼吸道样本;SARS实验室检测方法一览表;SARS网络实验室检测内容与方法建议;HCoV（2012） 实验室检测;London1_novel_CoV_2012_nsp12(partial);系统发生分析;GenBank BLAST 比对结果;2.;引物设计与应用;引物设计与应用2;;核酸(基因)检测;冠状病毒检测通用引物对: Cor-FW (5-ACWCARHTVAAYYTNAARTAYGC-3) Cor-RV (5-TCRCAYTTDGGRTARTCCCA-3‘);定量 PCR，TaqMan体系;定量RT- PCR检测;后续工作; SARS是否会再次出现？;病毒病应急技术中心简介 位于昌平区中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所新址主楼5层西侧，总面积约为700平方米，含常规分子生物学、细胞培养、血清学及BSL-1、BSL-2及BSL-3（主楼6层）等病原研究实