RNA组学及miRNAPPT.ppt

RNA组学与转录后调控 ; ;RNA组和RNA组学 ; RNA有催化功能 rRNA有转肽酶活性 RNA编辑、RNA的再编码 RNA作为端粒酶的组成成份在维持端粒DNA长度中的模板作用等等。 这使得人们逐渐接受生命可能起源于RNA而非DNA的观点，逐渐认识到RNA的生物学功能远非仅仅传递遗传信息那么单一。 ;转录 ; UGA 帽状结构 UAA 定位信号 多聚A尾 5’ m7GpppNm AUG UAG AAUAAA poly(A) 3’; ;Coding RNA mRNA中的编码区（即开放阅读框，open reading frame, ORF); ;自私的RNA( Selfish RNA) RNA既是自身复制的模板，又是催化分子 RNA是蛋白质生物合成的中心位置，控制着肽键形成的催化功能 RNA将绝大部分贮存遗传信息的功能交给DNA时，自私RNA (selfish RNA)的优先复制特性成为柔性生物进化的空间 人基因组中，大部分DNA组来自RNA反转座子的作用以及依赖于RNA的阅读和改写遗传信息的过程 ncRNA处于生命的中心，既控制编码RNA的翻译，又可随时产生新的ncRNA。生物的基因组构建、贮存和表达RNA ;;PNAS, December 19, 2000 vol 97 no. 26 14035-14037 ;RNomics的内涵;; MicroRNA;microRNA的发现与发展;计算机预测各种生物中miRNA基因的数目;miRNAs的重要特点: 时序特异性与组织特异性;miRNA的表达及作用机制;microRNA的产生和作用机制;1. miRNA基因在染色体上的分布;2. miRNAs的发生和作用机制模型;Cell 118(1), 2004 ;;;;RISC; RISC 还含有其他一些蛋白质组分，包括Vasa内含子基因蛋白质(VIG)、脆弱X蛋白的果蝇同源物(DmFXR)、Tudor-SN、潜在的RNA 解旋酶Dmp68 及Gemin3 等。这些蛋白质成分不是RISC核酸酶活性必需的，可能具有其他作用。; RISC是一至少由5个分子组成的超分子结构（AGO2，VIG-1，ARMI，AUB 及FXR相关分子）。 当RISC结合至mRNA时，mRNA被降解而不能被翻译。其他参与RNAi的成分还有RNA依赖的RNA聚合酶、解螺旋酶、dsRNA核酸内切酶[19]以及Exportin-5等，Exportin-5介导siRNA前体的出核转运 ;AGO2的作用机制;○ 第一种以线虫lin-4为代表，作用时与靶基因不完全互补结合，进而阻遏翻译而不影响mRNA的稳定性，这种miRNA是目前发现最??的种类。 ○ 第二种以拟南芥miR-171为代表，作用时与靶标基因完全互补结合，作用方式和功能与siRNA非常类似，最后切割靶mRNA，这说明某些miRNA和siRNA一样参与了机体内一些特异性mRNA的剪切过程。 ○ 第三种以let-7为代表，它具有以上两种作用模式，当与靶基因完全互补结合时，直接靶向切割mRNA，如果蝇和Hela细胞中let-7直接介导RISC分裂切割靶mRNA；当与靶标基因不完全互补结合时，起调节基因表达的作用，如线虫中的let-7与靶mRNA3′端非翻译区不完全配对结合后，阻遏调节基因的翻译。 ○ 第四种作用时与靶基因3’非翻译区结合，进而影响mRNA的稳定性。;miRNA是基因调控网络的一个关键成分, 能调控大量的靶基因的表达。;miRNA功能研究方法;Derived from J.-J. Song et al., Science 305, 1434 -1437 (2004) ;miR-1 Hand2 protein Hand2 mRNA Proliferation/growth;Neuron 46(3):363-367,2005.;miRNA调控造血干细胞的分化;miRNA基因异常与肿瘤发生相关;某些定位在染色体的脆性位点(FRAs)的miRNAs与肿瘤的发生有关;Nature 435(7043):834-838,2005.;let-7与肺癌的关系;Nature 435(7043):828-833,2005.;Nature Med 11(7): 713-714,2005