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- 2018-10-01 发布于江苏
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分子生物学课件之DNA复制2PPT
第三节:Eukaryotic DNA replication 一、复制起点与起始 真核生物的DNA复制发生在S期。在真核生物的基因组中,并非所有的复制子都同时进行DNA复制,而是按一定的顺序分批进行。构成常染色质的DNA在S期的早期复制,异染色质DNA主要在S期晚期复制,着丝粒DNA和端粒DNA复制时间最晚。现在尚不清楚控制复制早迟的分子机制。 在真核生物中复制起始区有没有特殊序列呢?同研究大肠杆菌oriC序列的一样,通过把酿酒酵母基因组DNA片断插入到无复制功能的质粒中,发现了能够使重组DNA分子在酵母中自主复制的酵母基因组顺序,称为自主复制顺序(autonomously replicating sequences)或叫ARS元件。在一个~180 bp的ARS(ARS1)中鉴定出了一个复制起始必需元件,即15 bp的元件A,和另外三个能够提高起始效率的短片断,分别称为B1、B2和B3。比较一下酵母中多种ARS元件可发现有11bp的保守顺序 [A/T]TTTAT[A/G]TTT[A/T]。A和B1是由6个蛋白质亚基构成的起始识别复合物(origin recognition complex,ORC)的结合部位。一旦被CDKs激活,ORC允许DNA双链打开,为DNA聚合酶提供模板。 二. Replication forks SV40的DNA为一5 Kb的双链环状DNA,进入细胞核后会形成核小体。SV40 DNA为研究哺乳动物的复制叉提供了非常好的模型。与大肠杆菌的复制起始过程一样,SV40 DNA的复制也发生在一个特定的位点上。病毒编码的T抗原是一种位点专一性DNA结合蛋白,它与SV40 DNA的复制起点结合,利用解旋酶活性局部打开DNA双螺旋。DNA双螺旋的打开还需要ATP和复制蛋白A(replication protein A, RPA)的参与,RPA实际上是一种宿主细胞编码的单链结合蛋白。 在真核细胞中,引发酶与DNA聚合酶α形成一个复合物,这个复合物在复制起点与单链模板结合,并合成大约10个核苷酸长的RNA引物。接着,RNA引物要被DNA聚合酶α延伸一小段距离。 因为DNA Polα/引物酶的延伸能力相对较低,很快就被高延伸性的DNA聚合酶δ或聚合酶ε取代。聚会酶δ或聚合酶ε取代DNA Polα/引物酶的过程称作聚合酶切换(polymerase switching)。发生聚合酶切换时,细胞复制C(replication factor C, RFC)结合到延长的引物上,催化装配由增殖细胞核抗原(proliferating cell nuclear antigen, PCNA)构成的滑动夹子在模板-接头上的组装,然后DNA聚合酶δ(polδ)结合到PCNA上并最终完成冈崎片段的合成,所以RFC是一种夹子装载因子(clamp-loading factor)。当遇到原先已形成的冈崎片段5`末端时,polδ/PCNA复合物从DNA上释放下来。 复制蛋白A(RPA) 后随链模板 聚合酶?/引发酶 A B C D E F G PCNA 复制因子C(RCF) 聚合酶? RNA引物 RNaseH/FEN1 冈崎片段 图12-4 参与真核DNA复制的酶及蛋白因子(前导链未标明) 引物的去除通过两个步骤,首先由RNase H降解大部分RNA引物。由于RNase H断裂两个核糖核苷酸之间的磷酸二酯键,因此会留下单个核糖核苷酸连接到冈崎片段上。最后一个核糖核苷酸则由側翼内切核酸酶(flap endonucleae 1, FEN1)除去。FEN1也能除去由于DNA聚合酶δ产生的某些错误的碱基。DNA连接酶将相邻的两个DNA片段连接起来,形成大分子DNA链。 三、Telomere replication 对于线形DNA分子来说,后随链的半不连续合成并不能复制后随链模板的3’末端。新的冈崎片断引物的合成位置通常距上一个冈崎片断200 bp。如果最新合成的冈崎片断的5’末端距模板的3’末端不足200 bp,那么就没有足够的空间引发另一次合成,这样后随链的最后一个冈崎片断便无法合成。即使后随链的最后一个冈崎片断的引物刚好位于随链模板的3’末端,变短仍会发生,只是程度较小,因为末端的RNA引物不能通过标准的途径转变为DNA。所以后随链总是比模板链短一段。 为了避免线形DNA分子的末端随着DNA的复制越来越短,真核生物染色体的末端(端粒)形成了特殊的序列,由数百个简单序列串连重复而成,并且具有3’ 突出端。并且端粒DNA的一条链富含G。例如,构成四膜虫端粒DNA的重复单位是TTGGGG,哺乳动物端粒DNA的重复单位是TTAGGG。端粒DNA的方向也是保守的,富含G的互补链的走向是5至3 方向,构成端粒DNA的3’末
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