生物芯片理论与实验培训资料.pdf

物秀-专心做 物 物秀-专心做 物 生物秀论坛—学术交流、资源共享与互助社区 http:// 生物部落—生物医药人网络家园 http:// H 生物百科—生命科学第一百科 http:// B 生物秀知道—生命科学问题解决之道！ http:// A 易生物-领先的生物医药商务平台 生物芯片理论与实验 培训资料 张亮 博士 主编 博奥生物有限公司 生物芯片北京国家工程研究中心 前 言 生物芯片技术自 20 世纪 90 年代初期被报道，在迄今约 20 年的时间里，它所 覆盖的内涵在一直不断地扩大，技术方法也在一直不断地完善。按照用途来分， 生物芯片又可以分为基因表达谱芯片、MicroRNA 检测芯片、基因甲基化检测芯片、 转录因子 DNA 吸附位点检测芯片、微生物检测芯片等等；可以预计，在生物芯片 技术中，能高通量并行分析成千上万个基因表达的基因表达谱芯片技术在未来 10 年内将会成为分子生物学实验室中常规的实验技术。基因表达谱芯片技术普及的 原因除了它的重复性、精确性、灵敏度等技术指标逐步改善，已经能与传统的方 法，例如 Northern Blot 、定量RT-PCR 方法相媲美外，还将得益于具有自主知识产 权的国产关键生物芯片仪器研制开发的成功。 国内的很多生命科学研究者已经从原来的单个基因、单个蛋白的角度转入到组 学研究水平，并开始在使用与组学研究特点相适应生物芯片技术。针对国内已经 或者正在准备搭建生物芯片平台的分子生物学实验室，生物芯片北京国家工程研 究中心（简称“NERCBBT ”）凭借国家工程中心的科研地位，利用本中心整合了 分子生物学、精密仪器、光学、表面化学以及软件人才的优势，本着让研究者真 正把生物芯片技术用于实际研究的原则，特举办生物芯片技术理论与实验操作培 训班。此培训内容，很多来自于迄今为止的公开文献资料和我们实验室积累的经 验；尽管我们尽可能及时跟踪国际上生物芯片技术领域内的进展，一些概念和技 术方法可能还是没有及时更新，敬请读者谅解。 生物芯片理论与实验培训资料 理论部分 总 概 在什么情况下用到生物芯片技术？ 1、高通量；2 、半定量 以下研究中，哪些情况适合使用生物芯片技术？ A 、检测某个药物处理细胞后，观察细胞的基因表达情况； B 、检测食品中是否有对人体有害的 5 种微生物存在； C、检测HPV 病毒中的是否存在能引发子宫癌的 11 种高危亚型； D 、检测牛奶中是否有结核杆菌存在； E 、检测在造血干细胞的分化过程中miR-223 是否有变化； 目前生物芯片的发展趋势，是和组学平行发展起来的。生物芯片技术已经进入到了生命科学 的哪些研究领域？ 检测DNA片段的缺失与扩增 12,13 检测DNA上的SNP 位点 3 检测DNA上甲基化位点 8,9 检测微生物的种类 5,6 DNA 芯片 检测基因表达 7 检测microRNA表达 4