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棉花种质资源遗传多样性及其ssr丰度分析 董薇
诵要
针对陆地棉、海岛棉、亚洲棉和草棉四大栽培棉种的96份种质进行表型性状及SSR分子标记遗
传多样性分析。基于简单重复序列类型和等位基因数量的多少,我们首次建立了SSR丰度统计方法,
分析了不同类型栽培棉种和陆地棉特异种质的SSR丰度差异。这对建立精确的品种指纹图谱、品种
和种质的纯度鉴定、种质遗传特性评价以及育种亲本选配和优势组合的预测都具有重要意义.主要
结论如下:
1、不同栽培棉种的种质问及种内品种间主要表型性状差异显著或极显著。陆地棉种质的表犁多
样性指数最高,为1.54,其他类型种质的多样性指数较低。96份种质具有丰富的SSR多样性,84个
和等位基因数均高于其他栽培棉种,国外陆地棉种质与国内陆地棉种质相比,遗传多样性稍低,但
品质和产量性状较好。sSR标记与农艺性状的多样性分析结果类似,进一步证明种质数量越多,类
型越丰富的棉种具有较高的遗传多样性。
2、四大棉种平均具有7.75个SSR特征位点,不同特性陆地棉种质存在各自的特异等位基因,
这可以用来区别不同棉种及其相应的特异种质。
的核心引物,可用于指纹图谱构建及种质问遗传关系的研究。不同染色体组分布的SSR位点进化水
平相差较大,A或D染色体亚组分布的SSR位点更易于鉴别四倍体棉种,而分布在A和D染色体亚
组上的SSR位点鉴别二倍体基因组更为有效。
4、SSR丰度统计结果表明,不同种质的SSR丰度和重复基序类型差异显著,并具有种届特异性,
四倍体棉种的SSR丰度高于二倍体棉种,草棉、亚洲棉、海岛棉和陆地棉的优势重复基序分别为
可以初步探索SSR丰度与种质的农艺经济性状的相关关系。
5、对栽培棉种的袁型性状和SSR分子标记进行聚类分析,均可将其划分为三个类群:二倍体类
群、海岛棉类群和陆地棉类群,而且在陆地棉类群中,退化陆地棉被明显地分为一个特殊亚群。在
同一棉种内,对于遗传相似性较高的种质,其表型性状和SsR分子标记聚类结果具有~定程度的差
异,这体现了不同类型种质的基因组和性状表达上的差异。
6、SSR相似性系数分析结果表明,四倍体棉种海岛棉的A组供体可能是草棉,而陆地棉的A
组供体可能为亚洲棉。
果表明二者在一致性序列数目、简单重复序列分布和优势重复基序类型上均有差别。因此,对四倍
体棉种的A、D亚组供体种中的SSR差异分析,为SSR标记的开发、棉种起源和进化的深入研究提
供更多有用的信息。
关键词:棉花种质资源,表型性状,SSR,遗传多样性,丰度
Abstract
The of96cottoll tofour
genetic cultivated
diversity germplasms,which
belong
andGherbaceum.we:lt_e
hirsutum,G,barbadense,Garboreum characterandSSR
carded∞phellolype
molecularmarkers.BasedOiltheSSR andthe of establishedthe
allele,we SSR
types quamity fistly
abundancestatisticalmethodand theSSRabundancedifferclmeindifferentofcultivated
analyzed types
cotton andthedire of cottons.Thishasvital for
spccles
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