第三章生物信息数据库检索及其应用3.pptxVIP

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第三章生物信息数据库检索及其应用3

提纲;分子生物学数据库的应用;数据库查询;数据库检索;数据库搜索;数据库查询、检索和搜索 ;核酸数据库序列查询系统;序列数据库检索 ;;NCBI;;GenBank;NCBI网站网址: ; GenBank数据库是由美国国立生物技术信息中心(NCBI)维护的一级核酸序列数据库。;检索界面;;Nucleotide 数据库分为三个子数据库:;检索界面;;;简介;简介;;;;;;;;;检索限定词:;简介;特殊标志符的格式(核酸序列) :;;特殊标志符的格式(核酸序列) :;;(1)mRNA 记录(NM_*): e.g.:NM_000492 (2)基因组的DNA重叠群(NT_*): e.g.:NT_000347 (3)完整的基因组或染色体(NC_*): e.g.:NC_000907 (4)基因组的局部区域(NG_*): e.g.:NG_000019 (5)从人类基因组注释、加工得到的序列模型(XM,XP,or XR_*): e.g.:XM_000483;;特殊标志符的格式(核酸序列):;简介;序列长度的检索限定词:[SLEN];;简介;范围检索:中间用冒号连接;简介;;;;限制检索;简介;限制检索范围;限制检索范围;排除某种类型的序列;限制分子类型; 限制基因位点; 限制基因位点;限制序列片段的显示;限制序列片段的显示;限制数据来源;限制数据来源;限制数据发布日期;限制数据发布日期;限制数据修订日期;限制数据修订日期;简介;;;;;;;;简介;;简介;;;;简介;;简介;;;;GenBank记录中特性表中的主要关键词:;关键词;关键词;关键词;限定词;限定词;限定词;限定词;GenBank和PubMed(序列数据)检索的比较:;在线获取批量序列(Batch entrez);;;ENTREZ特点;ENTREZ特点;ENTREZ特点;谢谢!

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