第六章 RNA分析PPT.pptVIP

* 第六章 RNA分析 一、 RNA简介 RNA的结构 RNA的功能 RNA研究进展 RNA的结构 一级结构 二级结构 三级结构 RNA的功能 调控蛋白的合成 RNA转录后的加工与修饰 生物催化及其他持家功能 调控功能 参与端粒RNA的合成 。。。。。。。。 RNA调控蛋白的合成 mRNA tRNA rRNA 生物催化及其他持家功能 类病毒 T4噬菌体的自我剪接 催化： DNA, RNA水解 核苷转移 多核苷酸磷酸化 氨酰-tRNA合成 调控功能 一类非编码RNA调控真核细胞许多功能，影响基因表达，细胞周期调控和个体发育等多种行为 miRNA siRNA 参与端粒RNA的合成 染色体3’DNA在端粒酶作用下，以端粒RNA为模板，合成端粒DNA 二、 RNA二级结构 RNA二级结构是指RNA分子在自然条件下盘绕、卷曲、借助碱基间的氢键相互连接形成部分碱基配对和单链交替出现的茎环结构。 GC AU GU RNA二级结构元件 凸环 双螺旋 内部环 发夹环 （茎环） RNA二级结构预测方法 基于热力学的预测方法 基于系统发生学的预测方法 基于热力学的预测方法 自由能最低---最稳定 局限性 RNA与其他生物大分子相互作用 RNA分子本身各二级结构元件间的相互作用 基于系统发生学的预测方法 通过进化和系统发生的原理，进行同源比对 局限性 受已知RNA结构限制 RNA结构预测分析资源 Vienna RNA package mfold server RNAstructure RNAstructure /RNAstructure.html 网上分析 本地软件下载分析 三、RNA interference (RNAi) RNA干扰 2006 Nobel Prize生理学（医学奖) 安德鲁·法尔（Andrew Fire） 克雷格·梅洛（CraigC.Mello) 概 念： RNA interference（RNAi） 与靶基因序列同源的双链RNA所诱导一种序列特异性的转录后基因沉默现象。 RNAi 发现历程： 1990年，曾有科学家给矮牵牛花插入一种催生红色素的基因，希望能够让花朵更鲜艳。但意想不到的事发生了：矮牵牛花完全褪色，花瓣变成了白色！ ? ? 1995年 康奈尔大学 Guo等在对线虫C.elegans的研究中，应用正义链RNA作为对照，研究par-1基因的表达，意外的发现，正义链RNA与反义链RNA同样能够抑制目的基因的表达。 1998年，Andrew Fire等首次将正义链反义链RNA混合注入线虫C.elegans中，观察到更强的基因表达抑制。首次提出了RNA interference的概念。 A control: not stained B: wt C: wt + antisense RNA D: wt + ds RNA Mex-3 mRNA detection in embryos by in situ hybridization *