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DNA提取和检测
实验准备工作:
1??所用离心管、枪头要洗净、烘干(最好灭菌)。
2??试剂配制:
1 M?Tris-HCl (pH 8.0):?称取Tris-Base?121g,?加入约800 ml?水在磁力搅拌器上搅拌,使其充分溶解后加入浓盐酸调整pH至8.0后加水定溶至1000 ml.?灭菌后于室温保存。
0.5 M?EDTA (pH 8.0):?称取EDTA-Na2盐?187 g?加入约?800 ml水,在磁力搅拌器上边搅拌边加入固体NaOH,当EDTA和NaOH均完全溶解,溶液变清时其pH值刚好达到8.0左右,再用pH试纸略加调整即可,?灭菌后于室温保存。
5.0 M?NaCl:?称取NaCl?300 g,?加入蒸馏水约800 ml?于磁力搅拌器上充分搅拌,约5分钟后停止搅拌,静止2~3分钟,倒出上清液,再加入100 ml蒸馏水重复前面的步骤,直到NaCl充分溶解后定溶至1000 ml.,?灭菌后于室温保存。
酚:氯仿:异戍醇(25:24:1)的配制:可参考《分子克隆》亦可按如下方法配制取重蒸酚100 ml?,蒸馏水50 ml,8-羟基喹咛0.05g?加入500 ml玻璃烧杯于磁力搅拌器上边加热边搅拌,待酚达到水饱和后加入18 g?Tris-Base,等Tris-Base?完全溶解后加入100 ml氯仿:异戌醇(24:1),搅拌10~20分钟,静止约10分钟,除去上层水相后,装入棕色瓶,最后加入20 ml?0.1M的Tris-HCl保护液于4℃保存。
DNA Buffer的配制:
1 M?Tris-HCl (pH 8.0) 100 ml 0.5 M?EDTA (pH 8.0): 100 ml 5.0 M?NaCl: 300 ml H2O 500 ml 灭菌后于室温下保存3个月左右,用时按1.5%往Buffer中加入CTAB,在电炉上烧开;在通风橱里加入1%的巯基乙醇(?现配现用)。
?
DNA的提取:
1???取2~5 g叶片或愈伤组织,加入适量液氮研碎,转入预冷的50ml离心管,加入20 ml DNA提取缓冲液充分摇匀,于65℃水浴60~90 min,中途轻轻摇匀两次。
2???加入15 ml?氯仿:异戍醇(24:1)轻轻摇匀10分钟,于BECKMAN离心机中4000 rpm离心15分钟。
3???取上清液于另一50 ml离心管加入10 ml?氯仿:异戍醇(24:1)重复步骤2。
4???吸上清液于一干净的50 ml?离心管,加入15 ml?冷冻的异丙醇,轻轻摇匀后于-20℃冷冻半小时,4000 rpm离心10分钟。弃上清液,加入5 ml 76%的乙醇(含10 mM
NH4Ac)浸泡5 h(或过夜),中途换乙醇2-3次。
5???弃乙醇风干沉淀约半小时,加入3.0 ml TE缓冲液(10 mM?Tris-HCl pH 8.0;1 mM?EDTA?, pH 8.0),20?μl RNase A(10 mg/ml),37℃温浴过夜。
6???溶液转入一10 ml离心管,加入3.0 ml苯酚:氯仿:异戊醇(25:24:1)充分颠倒混匀,4000 rpm离心15 min,吸上清液于另一10 ml的离心管中,(可重复一次)。
7???加入1 ml?5.0 M的NaCl和3.0 ml水饱和乙醚,充分混匀,4000 rpm离心5 min。
8???弃乙醚,用20 μl枪头挡住离心管管口内侧,用力下压枪头,使枪头与管壁间形成一狭缝,让下清液从缝中流入另一10 ml离心管。
9???加入5 ml冷冻的异丙醇,轻轻摇匀后于-20℃冷冻半小时,4000 rpm离心10分钟。弃上清液,加入3 ml 70%的乙醇浸泡4~6 h(或过夜),中途换乙醇2-3次。风干乙醇,加入500?μl TE溶解,或浸在乙醇中长期保存。
DNA检测
1?????????取DNA原液15 μl稀释至3.0 ml,用UV-1601型紫外分光光度计测定230 nm、?260 nm及280 nm的吸光值。
高质量的DNA要求:A260/A2302.0;?1.7A260/A2801.9
2???将DNA原液适当稀释后,用1?Χ?TAE,0.8%琼脂糖凝胶2V/cm电泳1 h进行质量检测。
3???向一定量的DNA中加入限制性内切酶EcoR?I至4-5U/μg DNA,37℃消化过夜,用0.5?Χ?TBE,0.8%琼脂糖凝胶2.5V/cm电泳3 h进行检测。
CTAB法微量提取DNA
1.?药品的配制:
??CTAB提取液:
(1)100mM?Tris-HCl(PH 8.0),1.5M?NaCl,50mM?EDTA(PH 8.0)
(2)1% PVP,2% CTAB
(3)取少许(1)加到(2)中,搅拌成糊状,后加(1)至足量,65℃水浴充分溶解备用。使用前要在
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