基础科学细菌的分类和鉴定ppt模版课件.pptVIP

细菌的分类和鉴定 一、微生物的分类 二、细菌的分类方法 （一）生理学与生化学分类法 1、传统分类法 2、数值分类法 （二）遗传学分类法 1、DNA G+C mol%测定 2、核酸同源值测定 3、核蛋白体RNA碱基序列测定 （三）两类分类法的优点和意义 三、原核微生物（广义细菌）分类系统 五、细菌的命名（一） 五、细菌的命名（二） 属名重复出现，可缩写 如：E.coli （大肠杆菌）； 只确定属名，未确定种名的某一株细菌 Salmonella sp. （沙门菌属）； 只确定属名，未确定种名的若干菌 Salmonella spp. 亚种用subsp.（正体）表示 Pasteurella multocida subsp. septica 六、微生物分类鉴定的依据 根据微生物分类学中使用的技术和方法，可把它们分成四个不同的水平： ①细胞形态和行为水平； ②细胞组分水平； ③蛋白质水平； ④基因组水平。 在微生物分类学发展的早期，主要的分类鉴定指标是以在细胞形态和习性为主，可称为经典的分类鉴定法 * * 根据微生物的大小、结构、组成等分三类 如：病毒、亚病毒、朊粒 非细胞型 如：真菌、原虫 真核细胞型 如：细菌、放线菌、螺旋体、支原体、衣原体、立克次体。（也称广义的细菌） 原核细胞型 根据每种细菌各自特征，并按照它们的亲缘关系分类，分类方法有两类 1.生理学与生化学分类法（传统方法） 2.遗传学分类法 主要以细菌的形态、染色以及细菌的特殊结构为最基本的分类依据，其它依据还包括细菌生长条件等等。 主要有两种方法 1、传统分类法 2、数值分类法 主要以细菌的形态、生理特征为分类基础，选择一些较稳定的生物学性状如细菌的形态结构、染色性、培养特性、生化反应、抗原性等作为依据，然后按主次顺序逐级区分。 对细菌各种生物学性状按“等重要原则”进行分类，选用多项生理、生化指标逐一进行比较，通过查表或计算机分析各菌间相似度，完成细菌分类。 以细菌的核酸、蛋白质等在组成的同源性程度分类。 主要有三种方法 1、DNA G+C mol%测定 2、核酸同源值测定 3、核蛋白体RNA碱基序列测定 DNA分子两条链上4种碱基的总分子量为100，测定其中G+C或A+T摩尔百分比，能反应出细菌间DNA分子的同源程度，习惯上以G+C 作为细菌的分类标记。 不同菌属间的G+C mol%范围很大，在25%~75%之间，但同一种细菌G+C mol%相当稳定，不受菌龄、培养条件和其它外界因素影响，亲缘关系越近的细菌，它们G+C mol%越接近（但并非G+C mol%越接近，亲缘关系就越近？？？）。 为什么不能说G+C mol%越接近，亲缘关系就越近？ 因为G+C mol%只能反映细菌的碱基总数而不能反映碱基序列！！！ 而利用DNA分子杂交的技术就可以精确测定DNA分子的碱基序列。这就是核酸同源值测定。 核蛋白体RNA碱基序列测定属于核酸范畴。 由于核蛋白体RNA（rRNA）序列比较保守，其变化十分缓慢。其中，16s rRNA具有高度的保守性和特异性以及该基因序列足够长，因此，被作为细菌鉴定的快速、准确方法，素有“细菌化石之称”。 主要用于分类 准确、可靠； 有利于了解细菌的进化和原始亲缘关系 遗传学分类法 主要用于鉴定 方便、简单、廉价 生理学与生化学分类法 意 义 优 点 方 法 《伯杰鉴定细菌手册》 (Bergey’s Manual of Determinative Bacteriology) 伯杰氏手册:是目前进行细菌分类、鉴定的最重要参考书，其特点是描述非常详细，包括对细菌各个属种的特征及进行鉴定所需做的实验的具体方法。 四、细菌的分类等级 界 （Kingdom） 门 （Phylum） 纲（Class） 目（Order） 科（Family） 属（Genus） 种（Species） 细菌的命名依据“国际细菌命名法规” 的规定，学名用拉丁文，遵循“双名法”。即每一种细菌的拉丁文名称由属名和种名两部分构成，属名第一个字母必须大写，其余均应小写（即使种名以人名或地名命名）。整个属名及