在克罗恩病病因学中一项关于NOD2基因易感性变异和吸烟之间的基因环境的相互作用的单纯病例研究课件.pptxVIP

在克罗恩病病因学中一项关于NOD2基因易感性变异和吸烟之间的基因环境的相互作用的单纯病例研究 分子遗传学 第三讨论组   文章结构框架 摘要 背景 结果 讨论 结论 方法 实验材料 作者资料 作者贡献 参考文献 出版前历史 摘要 背景：NOD2的遗传变异性和吸烟是CD发病危险因素，但它们之间的是否潜在相互作用尚不清楚。 方法：根据NOD2三个变异体（R702W，G908R，1007fs）进行基因分型；问卷调查获得吸烟史，使用单纯病例研究的设计，统计学上进行回归分析。 结果：检测到NOD2危险等位基因与吸烟史之间存在显著负相关，尤其适用于变异体1007fs。 结论：观察到基因与环境相互作用的显著负负相关可能是由于某个生物相互作用并值得进一步研究 背景 CD是常见的消化道炎症，目前公认具有遗传易感性，而最相关的基因为NDO2变异体 环境因素对其也有影响，而影响最大的是吸烟。 这两个因素之间是否存在相互作用尚不清楚。 两个亮点 最具代表性 单纯病例研究 OR值 OR=1 没有相互作用 OR》１协同作用 OR《１拮抗作用 结 果（1） 结果（研究样本特征） 表1提供了1636名患者的人口统计学和风险因素特征，对照组来自opgen生物样本库。 曾经吸烟的参与者诊断年龄和参与研究时的年龄均大于没有吸烟史的患者，同样确诊是吸烟者的年龄略大于非吸烟者。 至少一个相关等位基因者的确诊年龄比野生型基因患者要略年轻。 1007fs等位基因是唯一与较早的诊断年龄相关的基因,R702W，G908R，性别，纳入研究年龄，以及家族IBD病史都没有相关性。 结果（基因-环境交互作用分析） 我们观察到三个风险变异体基因中的至少一个载体与吸烟史之间的关系是显著背离我们建议的乘积函数模型的。这种背离表现在CD诊断是吸烟者中更明显。 发现在CD发病中，仅1007fs风险等位基因与吸烟史之间存在显著的负相关，而 在R702W和G908R风险等位基因不存在。 结 论 在克罗恩病人中吸烟和1007fs 呈显著的统计学负相关. 这一结果值得在流行病学功能研究方面进一步调查。它不仅更好地理解CD发病的生物学机制，也可以有助于为CD高发病率个体制定适当的建议。 方 法 研究设计 数据采集 人口分析 吸烟行为 基因分型 统计学分析 研究设计 CD患者的个体是1995至2010年连续招募的正在进行的研究的一部分，以此来确定遗传因素在炎症性肠病中的作用。 建立影像学和内窥镜的诊断标准来确定CD。 在参与者招募时从每个参与者获得一个外周静脉血样本。 从所有的研究参与者获得知情同意书。 所有患者都是通过popgen生物资料库被招募的 。 人口研究 共有2430德国个人与克罗恩病有资格参与目前的研究。经过两个筛选条件，1、在多重家庭中，最后的研究样本只包括索引患者，(指应用推荐治疗方案的特殊类型患者或者流行病学可追溯的第一例患者）。2.与者被包括在分析中仅当基因型数据对所有三个CD-相关NOD2多态性可用。排除有关联的和缺失基因型的参与者后，共1636个参与者可用于分析。 吸烟行为 在研究中通过给予参与者书面问卷调查获得的人口统计特征信息，疾病的具体信息，一般病史，家族病史，以及主动吸烟史。参与者被要求说明他们曾经是否主动吸烟者，并且被指定根据 “不吸烟”或者“曾经吸烟者”的回复给出问卷答复。参与者被进一步问，他们CD诊断期间是否吸烟。参与者指定为“曾经吸烟者”进一步细分为“确诊时吸烟”或“确诊时不吸烟” 。 基因分型 DNA是从每个使用标准方法的参与者的外周血淋巴细胞中提取的。如先前所描述的，在所有使用的TaqMan®SNP测定法基因分型的患者中，对R702W，G908R和1007fs多态性进行基因分型。 统计学分析 人口和风险因素变量在受试者中的选取和排除，通过x2检验分类变量和独立样本t检验连续变量 将基因和环境作为两个独立因素，在单纯病例研究中建立基因-环境乘积函数模型。 在初始组合等位基因分析，三个等位基因中至少携带一个的参加者单独成组并与携带三个等位基因的野生型进行比较。为了确定哪个多态性被促进的信号上检测在结合变异分析，我们再进行后续分别分析各多态性 进一步分析诊断时正在吸烟的患者对乘积函数模型的偏差是否更大。为了评估NOD2多态性的存在和吸烟状态之间偏离积性函数,我们应用R版本2.10.1表现逻辑回归分析 功率计算对联合等位基因分析。统计分析有吸烟史的交互作用，目前的研究中80%统计功效是去研究相互作用OR值为0.73（联合等位基因分析），0.67（R702W）,0.41(G908R),和0.7（1007fs）.我们的研究有80%的