基于Cyt b基因乌花杂交龟系统进化关系研究.docVIP

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基于Cyt b基因乌花杂交龟系统进化关系研究

基于Cyt b基因乌花杂交龟系统进化关系研究   摘要:利用PCR方法克隆乌花杂交龟线粒体DNA的细胞色素b基因(Cyt b基因),并结合GenBank中已公布的22种龟鳖类动物同源序列进行了序列变异比较和系统发生分析,采用NJ(Neighbor-joining)法和UPGMA法构建分子系统树。结果表明,乌花杂交龟与中华草龟(Chinemys reevesii)以很高的置信度聚成一支,再与中华花龟(Ocadia sinensis)聚成一组。   关键词:中华草龟(Chinemys reevesii);中华花龟(Ocadia sinensis);杂交龟;Cyt b基因;系统进化   中图分类号:Q959.6+3 文献标识码:A 文章编号:0439-8114(2013)17-4167-04   Study on the Phylogenetic Relation of Hybrid Turtle(Chinemys reevesii♀×Ocadia sinensis♂) Based on Cyt b Gene   HE Gang1,2,HE Li1,FANG Chun-lin2,FEI Chun-ping3,CHENG Bi-jun4   (1.Yangtze River Fisheries Research Institute, Chinese Academy of Fishery Sciences, Wuhan 430223, China; 2.Scientific Observing and Experimental Station of Fishery Resources and Environment in Poyang Lake, Ministry of Agriculture/Fisheries Research Institute of Jiangxi Province, Nanchang 330039, China; 3.Jiangxi Jinguiwang Business Co.,Ltd., Shangrao 334400, Jiangxi, China;4.Institute of Agricultural Quality Standards and Testing Technology Research, Hubei Academy of Agricultural Sciences, Wuhan 430064, China)   Abstract: The complete sequences of Cytochrome b(Cyt b)gene in the hybrid turtle were amplified by using PCR technology. Meanwhile, the homologous sequences of other 22 turtle species were obtained from the GenBank. Based on these data, the sequence variation and the phylogenetic relationship of these groups were analyzed. The phylogenetic trees were constructed using Neighbor-joining(NJ)and UPGMA methods. The results showed that the hybrid turtle and Chinemys reevesii firstly gathered into one clade,and then formed a group with Ocadia sinensis.   Key words: Chinemys reevesii; Ocadia sinensis; hybrid turtle; Cyt b gene;phylogenetic evolution   收稿日期:2013-03-13   基金项目:国家公益性行业(农业)科研专项(201003076)   作者简介:贺 刚(1982-),男,湖北天门人,助理研究员,硕士,主要从事种质资源与鱼类分子生态学研究,(电话电子信箱)   xyz001619@163.com;通讯作者,何 力,研究员,(电子信箱)heli28@。   中华草龟(Chinemys reevesii)俗称乌龟、泥龟、草龟,隶属于龟鳖目(Testudinate)地龟科(Emydidae)乌龟属(Chinemys);而中华花龟(Ocadia sinensis)又名花龟、珍珠龟、台湾草龟

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