基于全基因组的芽胞杆菌系统分类及系统发育研究.docVIP

基于全基因组的芽胞杆菌及系统发育研究 molacule phylogeny studies on Bacillus species based on the whole genome sequence 摘要：利用高通量基因组测序技术，测定芽胞杆菌属90%以上种类标准菌株（160株）和中国不同生境采集的200株芽胞杆菌，绘制芽胞杆菌属种类全基因组精细图，分析基因组序列相似性，建立基因组核心基因（core genes）平均核苷酸一致性（ANI），分析ANI与DDH（DNA-DNA杂交）相关性，用ANI替代DDH，成为基于全基因组测序的芽胞杆菌种类鉴定黄金标准，建立基于ANI芽胞杆菌网络比对鉴定系统。分析芽胞杆菌生理分化（如嗜盐、嗜酸、嗜碱、嗜冷、嗜热特性等）基因组序列的保守基因簇，利用MLST（多位点序列分型），进行分子系统发育分析，提出芽胞杆菌属依据生理分化的系统进化亚属分类单元或分群。分析中国芽胞杆菌种类资源和生态进化，编制中国芽胞杆菌名录，为进一步挖掘我国芽胞杆菌功能基因和应用领域提供科学基础。 Abstract: This study will sequence 90% species of standard strains (160 strains) in Bacillus genus and Chinas collection of 200 strains of Bacil