广谱沙粒病毒抑制剂的三维定量构效关系分析-three - dimensional quantitative structure-activity relationship analysis of broad spectrum sand virus inhibitors.docxVIP
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广谱沙粒病毒抑制剂的三维定量构效关系分析-three - dimensional quantitative structure-activity relationship analysis of broad spectrum sand virus inhibitors
广谱沙粒病毒抑制剂的三维定量构效关系研究广谱沙粒病毒抑制剂的三维定量构效关系研究IVIVIntroduction of bulky substituents with negatively charges at 16-position, hydrophobic groups at 19-position of Ar2; small substituents with positively charges, hydrophilic groups at 1-position of Ar1 can improve the inhibition potency; For both 17-position of Ar2 and 1-position of Ar1, the groups acting as H-bond acceptor are favorable for increasing the activities of the arenavirus inhibitors. All the conclusions might supply useful information for better understanding of the mechanism of broad-spectrum arenavirus inhibition and also be helpful in providing new clues for drug design and synthesis.Keywords: arenaviruses; hyriopsis cumingii; arenaviruses inhibitors; 3D-QSARVV目录摘要 IIIAbstract IV HYPERLINK \l _bookmark0 第一章 文献综述 11.1 沙粒病毒 11.1.1 沙粒病毒的结构和功能作用 11.1.2 沙粒病毒的发病机制 31.1.3 沙粒病毒引起人类的相关疾病 3 HYPERLINK \l _bookmark2 1.2 计算机辅助药物设计 81.2.1 定量构效关系 91.2.2 二维定量构效关系(2D-QSAR) 101.2.3 三维定量构效关系(3D-QSAR) 11 HYPERLINK \l _bookmark1 1.2.4 影响 3D-QSAR 模型的重要因素 13 HYPERLINK \l _bookmark1 1.2.5 QSAR 研究中模型的检验与评价 14 HYPERLINK \l _bookmark1 1.2.6 药效团模型 15 HYPERLINK \l _bookmark1 1.2.7 分子对接 16 HYPERLINK \l _bookmark1 1.2.8 分子动力学模拟 16 HYPERLINK \l _bookmark2 1.3 用于分子模拟计算的一些常用软件 17 HYPERLINK \l _bookmark2 1.4 存在的问题及研究意义 18第二章 广谱沙粒病毒抑制剂的定量构效关系模型 192.1 数据集的选择 192.2 分子构象的优化及叠合 21 HYPERLINK \l _TOC_250004 CoMFA 和 CoMSIA 分析 22 HYPERLINK \l _TOC_250003 PLS 分析 22 HYPERLINK \l _TOC_250002 2.5 CoMFA 数学模型结果 22 HYPERLINK \l _TOC_250001 2.6 CoMSIA 模型统计结果 24 HYPERLINK \l _TOC_250000 2.7 3D-QSAR 等势图结果和分析 272.8 结论 28第三章 研究展望 30 HYPERLINK \l _bookmark3 参考文献 31 HYPERLINK \l _bookmark3 附录 36 HYPERLINK \l _bookmark3 攻读硕士学位期间发表的学术论文 41 HYPERLINK \l _bookmark3 独创性说明 42 HYPERLINK \l _bookmark4 学位论文版权使用授权书 43 HYPERLINK \l _bookmark3 致谢 44 PAGE PAGE 1第一章 文献综述1.1 沙粒病毒1.1.1 沙粒病毒的结构和功能作用通过近几十年来的发展, 我国珍珠每年的产量将近超过了一千多吨, 稳居世界首 位, 成为又一种能够在国际市场占有重要地位的产品之一[1]。当前我国珍珠产量的 95% 以 上是由三角帆蚌生产的,但基础生物学研究及相关应用技术的研究在三角帆蚌中的需要远 远落后于当年经济快速的发展。尤其近几年后,频繁出现在各种水域中的三角帆蚌
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