武汉植物研究---甘蓝型油菜A基因组候选BAC克隆的筛选及其插入片段大小分析.docVIP

—————————————————————————————————————————————————————武汉植物研究---甘蓝型油菜A基因组候选BAC克隆的筛选及其插入片段大小分析 武汉植物学研究 2010, 28(6): 660~665 Journal of Wuhan Botanical Research DOI: 10.3724/SP.J.1142.2010.60660 甘蓝型油菜A基因组候选BAC克隆的筛选 及其插入片段大小分析 王太霞, 闫晓红, 查敏敏, 王力军, 魏文辉? 12122 (1. 河南师范大学生命科学学院, 河南新乡 453007; 2. 中国农业科学院油料作物研究所/农业部油料作物生物学重点开放实验室, 武汉 430062) 摘 要: 选择甘蓝型油菜A基因组10个连锁群上特有的85个SSR分子标记, 合成其引物序列, 采用四维PCR法筛选甘蓝型油菜-新疆野生油菜二体异附加系BAC文库, 成功筛选到甘蓝型油菜A基因组39个BAC克隆, 其插入片段介于50~300 kb之间, 平均为120 kb。甘蓝型油菜A基因组10个连锁群BAC克隆的获得, 对后续开展甘蓝型油菜A基因组染色体识别、基因染色体定位、遗传距离与物理距离间关系分析等均具有重要 价值。 关键词: 甘蓝型油菜; A基因组; SSR标记; 四维PCR; BAC克隆 中图分类号: S565.403 文献标识码: A 文章编号: 1000-470X(2010)06-0660-06 Screening and Insert Size Analysis of Candidate BAC Clones from Brassica napus A Genome WANG Tai-Xia, YAN Xiao-Hong, ZHA Min-Min, WANG Li-Jun, WEI Wen-Hui? 12122 (1. College of Life Sciences, Henan Normal University, Xinxiang, Henan 453007, China; 2. Oil Crops Research Institute of the Chinese Academy of Agricultural Sciences/Key Laboratory of Oil Crop Biology of the Ministry of Agriculture, Wuhan 430062, China) Abstract: Thirty-nine A genome specific BAC clones were successfully screened by four- dimensional PCR, with the primer sequences of eighty-five SSR markers located in the ten linkage groups of Brassica napus A genome from the BAC library of Brassica napus-Xinjiang wild rape disomic alien addition line. The thirty-nine screened BAC clones had an average insert size of 120 kb (range 50 to 300 kb). This set of BAC clones will be of interest to A genome chromosome identification, gene locating, and relationship analysis between physical distance and genetic distance in Brassica napus. Key words: Brassica napus; A genome; SSR markers; Four-dimensional PCR; BAC clones 自Landry和Hubert成功构建甘蓝型油菜第 一张分子标记遗传连锁图以来, 国内外不同实验 室又分别构建了其多张遗传图谱[2?8][1]锁图上的位置相同, 然而在染色体上并不等位。基因在染色体上真实位置的确定, 对于深刻认识基因组结构、染色体结构及目的基因的分离等均具 有重要作用。本研究从甘蓝型油菜-新疆野生油菜 二体异附加系BAC(bac