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在西北地区构建寄生虫标本网络数据库紧迫性
在西北地区构建寄生虫标本网络数据库紧迫性 摘要:标本室是农业类大学办学水平和科研实力的重要标志,是国家物种资源建设体系的有机组成部分。面对信息网络化的强大冲击,标本室改革发展的态势越来越迫切。因此,笔者在借鉴国内外相关院校合作开发网络教学平台经验的同时结合西北共享型专业教学资源库建设任务,对新疆农业大学现有标本存在的问题进行了分析,从寄生虫标本资源库系统建设的视角提出了标本数据化管理,促使西北农业高校标本室管理迈上了新的台阶。 关键词:西北高校;寄生虫标本资源;数据化管理 中图分类号:G642.0 文献标志码:A 文章编号:1674-9324(2014)39-0138-02 一直以来,农业高校标本室在我国高等教育由精英化到大众化乃至区域性的普及化过程中都做出了巨大贡献。然而随着网络技术的发展,使得当前西北地区寄生虫标本室的主要矛盾集中体现在实验室教学已经不能满足大家的需要,寄生虫标本数据化成了十分紧迫的现实问题。 1 国内外高校寄生虫标本室的发展现状 全球经济一体化进程和世界知识经济的发展使得世界各国都十分重视对寄生虫资源标本收集并设置了相关保藏机构,同时利用网络平台进行与各个国家进行资源共享。我国许多农业高校和研究所也争先踏入这个行列,如有代表性的中国农业大学、南京农业大学和上海兽医研究所等。 2 西北农林高校寄生虫标本室的现状及趋势 随着国家对西北地区畜牧业的日益关注,该区各大农业高校在实验室的管理上都小有成绩。就新疆农业大学而言,自1952年建校,动物寄生虫标本室迄今为止共收藏陈列标本1000余件、玻片标本5380件、病理标本200件、干制标本100余件、挂图80件以及其他标本759件。但是,随着学校办学规模的迅速增大以及网络信息化的飞速发展,标本室工作已出现严重滞后。 2.1 标本室自身问题频出 2.1.1 标本资源总量在减少,啃老程度加大。首先,随着寄生虫驱虫工作的开展,能采集到的典型寄生虫虫体标本越来越少;其次,几年来开设寄生虫实验的班级人数在不断地增加,标本的损坏也随之增大,尤其是玻片标本。如图1所示,是新农大寄生虫实验室近十年来玻片标本和陈列标本的减少趋势。 2.1.2 标本老化、陈旧及磨损。一些寄生虫陈列标本经过长期的保存,在形态、颜色等方面都发生了不同程度的变化;有些玻片标本渐渐磨损,详见图2所示,是新农大寄生虫标本长时间保存出现的问题之一。 2.1.3 珍罕标本的丢失。新疆草原家养家畜及野生动物的寄生虫标本资源较丰富,有些标本在内地其他高校几乎是没有的。然而随着标本室管理不善,很多标本逐年减少,部分珍贵标本也出现丢失现象。 2.1.4 管理制度不健全。没有制定专门针对动物寄生虫标本陈列室管理的制度,在标本外借或增减方面没任何记录;在标本日常维护上,无法做到规范化管理,遇到事故,无章可循。 2.2 西北农林高校间缺乏合作,无法实现资源共享 由于缺乏整体规划,各院校寄生虫标本资源库建设仍处于各自分散、自建自用、库与库之间自成体系状态,在信息技术、标本资源组织与开发方面,缺乏联合协作的意识,许多先进的管理理念、管理模式和管理方法也未被充分利用。 3 标本数据库系统的建立 3.1 统计、修复、新增 增加采样次数,对现有陈列标本和新增陈列标本按虫体的生物学分类进行统计,并做好记录。对标本液变黄、挥发、标签脱落等状况,采取保存液的全量更换或添加、原标本瓶的清洗或更换等修复措施。 3.2 数据化信息的采集及录入 3.2.1 图像信息的采集。通过尼康数码相机(Nikon CoolPix 5700)把寄生虫标本的各种特征数字化并利用Adobe Photoshop等计算机图像编辑处理软件和多媒体以及存储技术,对原始的寄生虫标本图像进行处理,如图片的正射纠正与部分截取(拉伸、旋转、剪切)、图片质量的改善(调整图片的颜色、亮度、对比度)、图片格式的转化、图片大小的调整等。如图3为处理过的图像信息。 3.2.2 文字信息的采集。根据《兽医寄生虫学》一书的分类标准,结合相关网站与资料查询对我校寄生虫标本室的标本进行了系统的文字整理并制作成寄生虫标本目录,包括中文名、拉丁文名、门、纲、目、科、属、种、虫体特征、寄生部位、生活史等基本信息,以此作为寄生虫标本数据化的原始文字。 3.2.3 信息的录入。利用JAVA编程语言,在后台按照检索条件(如:门、纲、目、科、属、种)将寄生虫目录文字信息依次输入,再在对应的界面插入相关图片,同时文档处标注寄生虫虫体的中文、拉丁文名称、宿主及寄生部位和简单的虫体特征,保存后生成文件。 3.2.4 生成数据,实现网络共享。建设一个统一、规范的寄生虫标本数据库,是实现标本资源共享的基础。各农业高校只有采用先进的集成
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