秦皇岛扇贝养殖区浮游病毒丰度及多样性的分析-analysis on abundance and diversity of planktonic virus in scallop culture area of qinhuangdao.docxVIP

万方数据 万方数据 秦皇岛扇贝养殖区浮游病毒丰度及多样性的研究 摘 要 众所周知，养殖活动会对海洋环境造成严重影响，但对其影响程度尚缺乏全 面认识，尤其养殖活动对浮游病毒等超微型浮游生物的影响未见全面系统的报 道。本文以秦皇岛扇贝养殖区为主要研究海域，采用了流式细胞仪技术分析了养 殖区浮游病毒及其宿主的丰度分布，并首次采用了宏基因组技术研究了养殖区浮 游病毒的多样性，同时与非养殖区浮游病毒的丰度分布以及多样性进行了对比研 究，以期探讨扇贝养殖对浮游病毒丰度及多样性的影响。 研究表明，在养殖区，浮游病毒丰度春、夏、秋、冬 4 季分别为 8.73×105 个/ml、1.05×106 个/ml、1.91×106 个/ml、6.13×105 个/ml，季节变化为：秋季＞夏 季＞春季＞冬季，峰值出现在秋季，但各季节差异不显著（P＞0.05）。聚球藻丰 度在 9.00×102-7.07×105 个/ml 之间，峰值出现在秋季，且显著高于其他季节（P ＜0.01）。微微型真核藻类丰度在 5.80×102-3.23×105 个/ml 之间，夏季“褐潮”爆 发期间，丰度达到 3.23×105 个/ml，显著高于其他季节（P＜0.01）。异养细菌丰 度在 3.10×105-3.79×106 个/ml 之间，夏、秋季丰度显著高于春、冬季（P＜0.01）。 相关性分析表明，在养殖区春、冬季，浮游病毒丰度与异养细菌丰度呈显著正相 关；在夏季，浮游病毒丰度与微微型真核藻类丰度成显著负相关；在秋季，浮游 病毒丰度与聚球藻丰度呈显著负相关。结果显示，养殖活动使养殖区浮游病毒丰 度在 4 季均与环境中丰度最高的宿主呈显著相关性，而这种相关性在非养殖区仅 出现在夏、秋季。养殖活动影响了聚球藻、微微型真核藻类和异养细菌的丰度及 季节变化。养殖区聚球藻丰度峰值出现在秋季，而非养殖区出现在夏季；夏季， 微微型真核藻类丰度在养殖区显著高于非养殖区；养殖区异养细菌丰度在夏、秋 季显著高于春、冬季，而在非养殖区无显著的季节变化。养殖活动使异养细菌成 为养殖区超微型浮游生物的主成分，而在非养殖区超微型浮游生物主成分则是微 微型真核植物。 宏基因组研究表明，在养殖区夏季检测到 2618 个病毒的 ORFs，包括噬菌体 （21%）、噬藻体（11%）、真核藻类病毒（20%）、动物病毒（0.8%）和未知病毒 （47.2%）。其中噬菌体和噬藻体的优势类群均属于肌尾病毒科，分别检测到 23 Ⅰ 种和 11 种；真核藻类病毒检测到寄生藻病毒属、颗石藻病毒属、绿藻病毒属和 褐藻病毒属，未检测到金藻病毒属和针胞藻病毒属。动物病毒检测到 6 种，其中 牛腹泻病病毒和恒河猴疱疹病毒属于陆源性动物病毒。在非养殖区夏季检测到 1574 个病毒的 ORFs，包括噬菌体（16%）、噬藻体（24%）、真核藻类病毒（5%）、 动物病毒（0.4%）和未知病毒（54.6%）。其中噬菌体和噬藻体的优势类群均属 于肌尾病毒科，分别检测到 13 种和 14 种；真核藻类病毒仅检测到寄生藻病毒属、 绿藻病毒属和褐藻病毒属；动物病毒检测到 6 种，其中长尾全裂茧蜂痘病毒和茧 蜂病毒属于昆虫病毒。病毒基因功能注释发现，在已预测到 27 种基因功能中， 最广泛的基因功能是复制与修复功能以及核苷酸代谢功能。结果显示，养殖活动 造成夏季养殖区噬菌体多样性和真核藻类病毒多样性升高；影响了噬藻体多样性 的季节变化，使其在养殖区春季和夏季均显著低于非养殖区；造成陆源性动物病 毒存在于海洋浮游病毒中，在养殖区夏季检测到的牛病毒性腹泻病毒和恒河猴疱 疹病毒 5 型属于陆源性动物病毒。 关键词：浮游病毒；宏基因组；流式细胞仪；基因功能 Study on Abundance and Diversity of Virioplankton in Scallop farming around Qinhuangdao Abstract Aquaculture activity has serious impact on marine environment, but there is a lack of comprehensive awareness about that, especially the effect of aquaculture activity on ultraplankton such as virioplankton. This paper studied the abundance and distribution characteristics of virioplankton and its host by flow cytometry and the diversity of virioplankton by metag