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《分子生物学》复习资料 二 第七章基因的转录 一、名词解释 1.转录：是指以DNA为模板，合成RNA的信息传递过程。除了某些RNA病毒的基因组之外，所有的RNA都是转录产物。 2.反义链：在基因的DNA双链中，转录时作为mRNA合成模板的那条单链叫做模板链或反义链。 3.上游顺式作用元件：在真核基因中存在着很多的位于转录起始点上游的顺式调控序列，这些DNA序列称之为上游顺式作用元件。是指与结构基因表达调控相关、能够被调控蛋白特异性识别和结合的DNA序列，包括启动子、上游启动子元件等，它们是通过与反式作用因子的相互作用来调节基因转录活性。 4.启动子：是基因DNA中一段特定的核苷酸序列，是与启动机因表达相关的顺式作用元件，式RNA聚合酶在转录起始时对模板DNA的识别位点和结合位点，是基因转录的开始部位,也即是转录是否能起始的决定位点。 5.终止子：促进转录终止的DNA序列，在RNA水平上通过转录出的终止子序列形成茎-环结构而起作用。又可分为依赖于ρ因子的终止子和不依赖于ρ因子的终止子两类。 二、思考题 1.原核生物和真核生物基因转录的异同? ①相同点：转录过程是相似的,都是以DNA的一条链为模板,4种NTP为底物,经过起始、延伸和终止三个阶段，以5′→3′方向合成RNA。 ②不同点： 原核生物真核生物 只有一种RNA聚合酶合成所有的RNA三种RNA聚合酶分别合成不同的RNA 不同的启动子间有相当大的同源性各种不同启动子间差异很大 聚合酶直接同启动子结合， 不需要另外的蛋白质成分聚合酶通过同转录因子的相互作用进行转录 无增强子有增强子序列对转录进行调控 启动子一般位于结构基因之前聚合酶Ⅲ的启动子位于被转录的序列之中 2.熟悉原核生物启动子的结构与功能、其中的-35区、-10区等的结构? ①域中的基序并与之结合，启动转录的起始。一般将DNA上的转录位点定位+1来排序，其下游(右侧)为正值，其上游(左侧)为负值。原核生物不同基因的启动子虽然结构也有一定的差异，但明显具有共同的特点。◆结构典型，都含有识别(R)，结合(B)和起始(I)三个位点；◆序列保守，如-35序列，-10序列结构都十分保守；◆位置和距离都比较恒定；◆直接和多聚酶相结合；◆常和操纵子相邻；◆都在其控制基因的5′端；◆决定转录的启动和方向。 ②-35序列又称为Sextama盒,其保守序列为TTGACA，与-10序列相隔16~19bp。其功能是：◆为RNA聚合酶的识别位点。RNA聚合酶的核心酶只能起到和模板结合和催化的功能，并不能识别-35序列，只有σ亚基才能识别-35序列，为转录选择模板链。◆-35序列和-10序列的距离是相当稳定的，过大或过小都会降低转录活性。这可能是因为RNA聚合酶本身的大小和空间结构有关。 ③-10序列也称为Pribnow框盒,其保守序列为TATAAT，位于-10bp左右，其中3′端的T十分保守。A,T较丰富，易于解链。它和转录起始位点I一般相距5bp。其功能是：◆与RNA聚合酶紧密结合；◆形成开放启动复合体；◆使RNA聚合酶定向转录。 3.原核生物转录的起始分几个阶段? ①核心酶在σ因子参与下接触到DNA上，形成特异性结合； ②起始识别，RNA聚合酶与启动子结合，形成封闭性起始复合物； ③从封闭性转变为开放形起始复合物，酶结合在-10序列，启动子活化，并解开双链结构，暴露模板链； ④形成DNA-酶-底物NTP的三元起始复合物，酶移动到转录起始位点，在起始位点加上开头的几个核苷三磷酸。 4.真核生物基因类型II启动子的结构与功能? ①转录起始位点：是RNA合成的开始位置； ②基本启动子：和Inr一起构成核心启动子； ③转录起始位点下游元件： ④转录起始位点上游元件： 5.真核生物基因转录的一般规律? ①典型的真核基因转录单元为单顺反子，原核为多顺反子。 ②真核生物的RNA聚合酶高度分工。 ③转录的正常进行，除了需要RNA聚合酶以外，还需要许多蛋白质因子的参与。 ④真核基因DNA的顺式作用元件要比原核基因复杂得多。 ⑤真核基因的转录调控以正调控为主。 第八章转录后加工 一、名词解释 1.转录后加工：在转录中新合成的RNA往往是较大的前体分子，需要经过进一步的加工修饰，才转变为具有生物学活性的、成熟的RNA分子，这一过程称为转录后加工。 2.多顺反子：在原核细胞中，通常是几种不同的mRNA连在一起，相互之问由一段短的不编码蛋白质的间隔序列所隔开，这种mRNA叫做多顺反子mRNA。 3.RNA编辑：某些mRNA的核苷酸序列，在生成转录产物后还需插入、删除或取代一些核苷酸残基，方能生成具有正确翻译功能的模板，遗传信息在mRNA水平上的改变过程，称为RNA编辑。 二、思考题 1、内含子RNA剪接的三种方式? 第一类：自我剪切。由于内含子的特殊结构而能自发地