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sim凝胶成像分析系统bio-1d中文操作说明书
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:打开一个新图形
:打开已保存的分析结果
:保存图像
:保存分析结果
:剪切,点击图标后出现一方框,拖动方框中间可以移动方框位置,拖动方框边缘可以变化方框大小以适应所选择区域大小,点击蓝点确定
:复制,使用方法同“剪切”
:粘贴
:打印
:软件版本信息
:帮助。点击图标可以出现各个图标的帮助信息
:标注
:顺时针90°旋转
:垂直镜像旋转
:水平镜像旋转
:黑白转换
:对比度调节
:彩色模拟显示
:放大区域选择
:放大缩小,使用方法同“剪切”
:分析蛋白、SDS核酸电泳的分子量、片段大小、相对迁移率以及样品相对定量等
:单条带、狭缝印迹、NORTHERN印迹、TLC板的定量
:滴定板的定量
:酶标板的定量
:分子杂交菌落计数
分析过程:
点击后,出现如下的有关分子量和相对迁移率等图标
计算分子量,关于
点击后,出现如下图:
Lanes direction是代表电泳的方向,有两个选项,一个就是常见的垂直电泳Vertical lanes,另外是水平方向电泳Horizontal lanes,具体选择可以根据自己的电泳方向的不同来选择适合的选项。
Total代表总的泳道数,Gap是调节泳道间的距离。
Hor.Rot和Ver.Rot分别代表水平和垂直电泳泳道的倾斜度。
点击可以单独调节每个泳道。
点击可以恢复至原始数据,点后关闭该对话框。
点击进入条带检测对话框。
关于:该功能主要是校正电泳时出现的泳道倾斜的情况
关于:
点击后,出现以下对话框:
勾选上后,可以对所有泳道进行条带检测;如果取消则可以选择不同泳道进行单独条带检测。
可以根据感兴趣条带亮度的强弱来选择Sensitivity数值的大小
根据色谱原理进行精确条带选择,Lane num.代表第几泳道,Line Cur.和Rect. Cur.分别是用双箭头直线和方框进行条带和标记的对应,Rectangle cursor size是直线和方框的大小。
Migration Correction的功能主要是用于多个电泳图谱间位置的调整。
4、:进行标准分子量的确定
点击,会出现如左图的对话框
Marker num.是确定标准分子量在第几泳道
Assignment是分子量数值和条带如何对应,有Automat.自动的和Manual手动两种。
Reset是恢复原有设置
Mark value分子量数值的获得可以通过以下几种方法得到:
Load:调用原来已经保存过的文件
Save:保存输入的数值成一个文件
Modify:修改原有数据
Visual:查看输入的数值
New:新建一个文件
5、:进行分子量和相对迁移率数值显示的转换
6、:分子量或相对迁移率数值的显示
7、和:相近性分析
Selection of lanes:选择要对比的泳道
Confi:相近型
Similarity coeficcents:有两种计算原理Nei and Li和Jaccard
Dendrogram+Lane:选择可以同时观察到电泳图谱和相近型图谱
Dendrogram Disp. With:有Homology相近性和Distance远离型两种显示方式
下拉菜单有各种如UPGMA类似的计算公式供使用
Dendro/Matrix Disp.:图谱和矩阵显示的切换
Validate:校正
8、:去除底色,数值需要摸索,数值大约在25左右
9、:峰面积和峰体积的计算
10、:根据标准进行相对定量的计算
11、:根据理论数值对计算数据进行校正
12、:图形显示数据
Ref. win.:泳道
Displ. Mode:有3D和曲线Curve两种显示方式
Display:显示
Data Type:要显示的数据类型
Lanes for comparison:要对比的泳道
Select all:全选
Reset:取消选择
Comparison:进行对比
13、:保存试验信息
14、:保存试验结果,以后可以随时调用。
15、:显示数据结果
16、:继续调节对比度
17、:矩阵数据颜色调整
18、 菜单EditComments:调用分析的结果图形
:插入分析的图谱
:插入标准分子量曲线
:插入分析后的条带
:插入分子量数据
:插入相近性的矩阵
:插入相近性分析图形
:插入条带匹配图形
:插入条带匹配电泳图谱
:插入条带峰体积
:插入根据参照得出的条带峰体积
: 插入标准数据
:插入根据标准得出的相对数据
:插入试验说明
:保存图形和文字成一个文件
:调用原有文件到新注释commentsS里
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