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基于CUDA加速MATLAB计算研究

基于CUDA加速MATLAB计算研究   摘 要:介绍了NVIDIA公司新的编程框架CUDA的特点以及CUDA加速MATLAB的方法,测试了CUDA加速岩土工程中常用的算法如矩阵计算、快速傅里叶变换、支持向量机。随后分析了数据规模、算法复杂性与加速效果的关系,指出了基于CUDA的MATLAB加速计算的应用前景。测试结果表明,CUDA方式相对传统计算方式的最好加速效果分别达到了22.39倍、46.88倍、51.32倍,证明了CUDA加速计算的有效性。   关键词:统一计算设备架构; MATLAB; 加速计算   中图分类号:TP311文献标志码:A   文章编号:1001-3695(2010)06-2140-04   doi:10.3969/j.issn.1001-3695.2010.06.041      Model of accelerating MATLAB computation based on CUDA      LIU Shao??bo, LIU Ming??gui, ZHANG Guo??hua      (State Key Laboratory of Geomechanics Geotechnical Engineering, Institute of Rock Soil Mechanics, Chinese Academy of Sciences, Wuhan 430071, China)      Abstract:The character of NVIDIA Corporation’s new program framework, described CUDA and its usage of accelerating MATLAB computation based??on CUDA firstly. Then tested the algorithms of matrix computation, fast fourier transform (FFT), support vector machine (SVM) in detail while used those algorithms widely in geotechnical engineering. Analyzed the relationship between acceleration performance and data size or algorithm complexity. Finally, discussed the prospect of accelerating MATLAB computation based??on CUDA.   The test shows that these algorithms computed by CUDA are 22.39 times, 46.88 times and 51.32 times faster than those by traditional ways.   Key words:compute unified device architecture(CUDA); MATLAB; accelerating computation      由于边坡、隧道等岩土工程的地质条件限制,人们很难深入了解岩土工程内部的复杂结构。对于这类问题的研究,常用有限元[1]、神经网络[2~4]等方法,模拟或预测环境内部的一些参数变量如温度、应力等。许多研究人员利用MATLAB软件的强大功能,在上述研究中取得了不错的成绩,给科研工作带来了很大便利。   MATLAB虽然在易用性等方面有着许多优点,但是其计算速度慢、效率低,尤其是在大规模计算方面常常需要耗费较多时间。为了解决MATLAB计算效率问题,目前研究人员大多数尝试下述两种方式:a)通过购买昂贵的服务器、工作站等设备,来加快MATLAB计算速度。这种方式虽然能够很好地解决计算速度问题,但是给科研人员带来了经济上的负担。b)移植MATLAB算法,通过高级语言如C++等重新编制程序,提供执行效率。这种方式虽然能够显著提高MATLAB计算速度,但是对研究人员的编程功底要求较高,而且有些算法本身很复杂,C++等高级语言没有提供相应的库函数,这需要研究人员从底层开始实现算法,费时费力,加大了科研工作量。   近几年来,计算机显卡核心单元GPU(graphics processing unit)在浮点运算性能方面取得了突飞猛进的发展(如NVIDIA公司推出的GeForce GTX200系列高端显卡,浮点运算速度逼近每秒万亿次左右,相当于过去小型机的处理能力),GPU以其远远超过CPU的浮点运算性能、高

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