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第一部分:荧光定量PCR实验
一、实验材料
1.主要试剂:
Bacto-trypton、Bacto-yeast extracion 英国OXOID公司产品
氨苄青霉素: 德国B.M.公司产品DH5α感受态菌株: 为本实验室提供
T-载体质粒Pmd18 大连宝生物工程公司产品100bp ladder,λ-DNA EcoRⅠ/HindⅢ marker 华美生物工程公司产品
QIAE Ⅱ Agarose Gel Extraction Protocal 德国Qiagen公司产品
RESINcolumnTM小批量质粒DNA纯化系统 华美生物工程公司产品 细胞RNA提取试剂: Trizol 索奥公司产品
RT-PCR试剂 索奥公司产品
逆转录酶系: 索奥公司产品
dNTPs: 索奥公司产品
DEPC 美国Sigma公司产品RNasin 美国Promega公司产品
2.主要实验仪器:
超净工作台: 苏州净化设备公司紫外分光光度计(UV-1206): 日本SHIMODZU公司产品冷冻离心机(SCR20B): 日本HITACHI公司产品台式低温高速离心机(Z323K) 德国HERMLE公司产品台式高速离心机(TGL-16G) 上海安亭科学仪器厂产品水平离心机 上海安亭科学仪器厂产品
水平式电泳仪 北京东方仪器厂产品GDS7600凝胶扫描系统(DF-23B) 英国UVP公司产品HZ-25空气恒温振荡器 江苏大仓医疗仪器厂产品普通培养箱 日本SANYO公司产品电子天平(BS210S) 日本Satorius 公司产品-80℃冰箱 日本SANYO公司产品PE97
PE7700荧光定量PCR扩增仪 美国PE公司产品
二、实验方法
荧光定量RT-PCR检测HSP27方法的建立
荧光定量PCR是近两年发展起来的一项新技术[43-45]。其原理是在常规PCR扩增系统中加入一段与靶基因特异互补的荧光标记探针。探针的5端标记有报告基团(Reporter, R),如FAM、VIC等。3端标记有荧光淬灭基团(Quencher, Q),如TAMRA等。探针的3端羟基已被封闭,不具有延伸功能。当探针完整的时候,报告基团所发射的荧光能量被淬灭基团吸收,仪器检测不到荧光信号。随着PCR扩增的进行,引物沿着模板延伸, Taq酶在链延伸过程中遇到与模板结合的探针,其5→3外切核酸酶活性就会将探针切断,报告基团远离淬灭基团,其能量不能被吸收,即产生荧光信号。所以,每经过一个PCR循环,荧光信号也和目的片段一样,有一个同步指数增长的过程。信号的强度就代表了模板DNA的拷贝数。用荧光检测仪检测荧光值的变化,即可准确判定扩增产物的量。荧光定量PCR方法就是利用此原理,在PCR过程中,连续不断地检测反应体系中荧光信号的变化。当信号增强到某一阈值,此时的循环次数(用循环阈值
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