2、分子生物信息数据库_New幻灯片.pptVIP

第二章 分子生物信息数据库 一、 分子生物信息数据库简介 （二）、序列数据库 1、核酸序列数据库 （1）欧洲分子生物学实验室的EMBL（European Molecular Biology Laboratory） http://www.embl-heidelberg.de （2）美国生物技术信息中心（National Center for Biotechnology Information）的GenBank /Web/Genbank/index.html （3）日本遗传研究所的DDBJ （DNA Data Base of Japan） http://www.ddbj.nig.ac.jp/ 2、EMBL和GenBank数据库格式 除了蛋白质序列数据之外，PIR还包含以下信息： (1)蛋白质名称、蛋白质的分类、蛋白质的来源； (2)关于原始数据的参考文献； (3)蛋白质功能和蛋白质的一般特征，包括基因表达、翻译后处理、活化等； 注释包括： （A)蛋白质的功能描述；(B)特殊位点和区域 ，如钙结合区域、ATP结合位点等； (C)与其它蛋白质序列的相似性；(D)序列残缺与疾病的关系； （三）、 结构数据库 1、PDB（Protein Data Bank） PDB中含有通过实验（X射线晶体衍