不同品系中华鳖线粒体基因组部分序列SNP分析和种质鉴别-水产养殖专业论文.docxVIP

万方数据 万方数据 独 创 性 声 明 本人郑重声明：所呈交的论文是我个人在导师指导下进行的研究工作及 取得研究成果。尽我所知，除了文中特别加以标注和致谢的地方外，论文中 不包含其他人已经发表或撰写的研究成果，也不包含为获得宁波大学或其他 教育机构的学位或证书所使用过的材料。与我一同工作的同志对本研究所做 的任何贡献均已在论文中做了明确的说明并表示了谢意。 若有不实之处，本人愿意承担相关法律责任。 签名： 日期： 关于论文使用授权的声明 本人完全了解宁波大学有关保留、使用学位论文的规定，即：学校有权 保留送交论文的复印件，允许论文被查阅和借阅；学校可以公布论文的全部 或部分内容，可以采用影印、缩印或其他复制手段保存论文。 （保密的论文在解密后应遵循此规定） 签名： 导师签名： 日期： 宁波大学硕士学位论文 不同品系中华鳖线粒体基因组部分序列 SNP 分析和种质鉴别 摘 要 本 研 究 以 浙 江 省 主 要 养 殖 的 四 个 品 系 中 华 鳖 (太 湖 品 系 、 台 湾 品 系 、 黄 河 品 系和 日 本 品 系 )为 研 究 对 象 ， 通 过 对 线 粒 体 DNA部 分 序 列 进 行 PCR扩增并对产物 进 行 测 序 ， 对 测 序 结 果 进 行 比 对 分 析 ， 计 算 不 同 品 系 的 遗 传 多 样 性 参 数 以 及 系 统发 生 关系 ， 并筛 选 各个 品 系的 特 异性 SNP位点 ， 通过 对 这些 特异 性 位点 进 行分 类， 用 不同 的SNP分 型方 法 进行 分 型， 以 期达 到 准确 鉴 别中 华 鳖种 质 的目 的 。具 体结果如 下： (1) 中华鳖 遗传多 样 性和进化 关系分 析 对 不 同 品 系 中 华 鳖 (每 个 品 系 各 20只 )的 16S rRNA全 长 基 因 约 1 608bp左 右 的 片 段 进 行 了 测 序 比 较 分 析 ， 结 果 表 明 ： 遗 传 多 样 性 由 高 到 低 依 次 为 太 湖 品 系 (0.863) 台 湾 品 系 (0.484) 黄 河 品 系 (0.195) 日 本 品 系 (0.100) ；共发现 18 种 单 倍 型 ， 不 同 品 系 之 间 间 均 无 共 享 单 倍 型 ， 表 明 通 过 线 粒 体 鉴 别 不 同 品 系 中 华 鳖 具 有可行性； MP进 化 树 和 遗 传 距 离 分 析 均 显 示 日 本 品 系 和 黄 河 品 系 的 亲 缘 关 系 较 近 ， 台 湾 品 系 和 太 湖 品 系 的 亲 缘 关 系 较 近 ， 分 别 聚 为 一 支 ， 推 测 最 初 引 进 日 本 的中华鳖 可能起 源于 黄河流域 。 (2) 不同品 系中华 鳖 线粒体特 异性 SNP的 筛选 通过对不 同品系 中华 鳖(每个 品系 15 个个体)线粒 体约 14 000 bp 的 DNA 片 段进行测 序对比 筛选 ，共筛选出 83 个特 异性 SNP 位点，包括 太湖品系 特异性 位 点 18 个，台 湾品系 特异性位 点 22 个， 黄河品系 特异性 位点 24 个， 日本品 系特 异性位点 19 个 ，在 这些特异 性位点 中有 3 个特异 性限制 酶切 位点。 (3) SNP 分型和 种质 鉴定 对筛选出的 3 个特异 性限制酶 位点用 PCR-RFLP 的 方法进 行分 型，结果 表 明此方法 可准确 鉴本 研究中的 4 个 品系中 华鳖。通 过设计 引物 进行 PCR 扩增， 对扩增产 物(含特异 性 SNP 位点)进行 HRM 分型， 结果表 明 15 对引 物组合 可用 于 分 型 鉴 定 ， 其 中 1 对 引 物 可 用 于 鉴 别 太 湖 品 系 ， 2 对 引 物 可 用 于 鉴 别 台 湾 品 系，3 对引物 可用于 鉴别黄河 品系， 1 对 引物可用 于鉴别 日本 品系， 3 对引 物可 同时鉴别 太湖品 系和 台湾品系 ， 1 对引 物 可同时鉴 别黄河 品系 和日本品 系， 1 对 引物可同 时鉴别 太湖 品系和黄 河品系 ， 3 对引物可 大致将 四个 品系分为 两组。 因 I 不同品系中华鳖线粒体基因组部分序列 SNP 分析和种质鉴别 此， 通 过 SNP 分型 方法 可 有效 鉴 别不 同 品系 中 华鳖 。 此外 ， 通过 对 每个 品 系各 20 个 个 体 进 行 了 盲 测 验 证 ， 验 证 结 果 与 预 期 结 果 相 一 致 ， 表 明 此 方 法 用 与 不 同 品系中华 鳖的种