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最长公共子序列(LCS)算法及报告-Read.doc
最长公共子序列 (LCS)算法及报告
一、实验名称
最长公共子序列问题
二、实验目的及要求
所涉及和需要掌握的知识:
1. 最优子结构性质:当问题的最优解包含子问题的最优子结构
2. 为了解决递归的重复调用问题,采用备忘录的方法,
3. 动态规划的基本原理:
在字母表上,分别给出两个长度为n和m的字符串A和B,这里A= … 的子序列是一个形式为 … 的字符串,其中每个都在1和n之间。例如 ={x,y,z},A=zxyxyz,B=xyyzx那么xyy同时是A和B的长度是3的子序列。然而。它不是A和B的最长的公共子序列,因为字符串xyyx也是A和B的公共的子序列。因此A和B的最长公共子序列的长度是4。
最后得到结论:如果i和j都大于0,那么
l 若 = ,L[i,j]=L[i-1,j-1]+1;
l 若 != ,L[I,j]=max{L[i-1,],L[I,j-1]}
三、实验环境
操作系统:WINDOWS 2000
使用软件:VC
使用语言:C语言
四、问题描述及实验内容
假设A=”xyxxzxyzxy”和B=”zxzyyzxxyxxz”,求出A和B的最长公共子序列的长度并输出其中一个最长公共子序列。
最后求得L[n,m]=6和最长子序列为xyxxxz
五、问题分析和算法描述
LCS的算法表示:
输入:字母表上的两个字符串A和B,长度分别为n和m.
输出:A和B的最长公共子序列的长度和其中一个最长子序列。
1. for i=1 to n
2. L[i,0]=0
3. end for
4. for j=0 to m
5. L[0,j]=0
6. end for
7. for i=1 to n
8. for j=1 to m
9. if = then L[i,j]=L[i-1,j-1]+1
10. else L[I,j]=max{L[i-1,],L[I,j-1]}
11. end if
12. end for
13. end for
14. return L[n,m]
LCS的图表示:
假设A=”xyxxzxyzxy”,B=”zxzyyzxxyxxz”
B
z
x
z
y
y
z
x
x
y
x
x
z
0
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
A
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
x
1
0
0
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
y
2
0
0
1
1
2
2
2
2
2
2
2
2
2
x
3
0
0
1
1
2
2
2
3
3
3
3
3
3
x
4
0
0
1
1
2
2
2
3
4
4
4
4
4
z
5
0
1
1
2
2
2
3
3
4
4
4
4
5
x
6
0
1
2
2
2
2
3
4
4
4
5
5
5
y
7
0
1
2
2
3
3
3
4
4
5
5
5
5
z
8
0
1
2
3
3
3
4
4
4
5
5
5
6
x
9
0
1
2
3
3
3
4
5
5
5
6
6
6
y
10
0
1
2
3
4
4
4
5
5
6
6
6
6
表(1)
六、实验步骤及实验结果
实验的具体步骤参考附录(源程序清单)。
实验结果:
七、总结
对上面正确结果中的矩阵进行分析:
1. 若i=0或j=0 L[i,j]=0
2. 若i0,j0和 = L[i,j]=L[i-1,j-1]+1
3. 若i0,j0和 != L[I,j]=max{L[i-1,],L[I,j-1]}
根据上述3点可以得到矩阵如上
对上面正确结果中的最长公共子序列进行分析:(走得路线自定义先向上再向左)
用c[6]来存公共子序列的字符。
1. 从L[10,12]出发向上走直到遇到第一个小于L[8,12]的停止,向左走同样直到遇到第一个小于L[8,12]的停止. =z把存入c[5]=z, L[8,12]向左上角跳到 L[7,11]
2. 从L[7,11]出发向上走直到遇到第一个小于L[6,11]的停止,向左走同样直到遇到第一个小于L[6,10]的停止.把 =x存入c[4]=x,L[6,10]向左上角跳到 L[5,9]
3. 从L[5,9]出发向上走直到遇到第一个小于L[4,9]的停止,向左走同样直到遇到第一个小于L
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